Treponema pallidum a typy herpes simplex virus 1 nebo 2 (HSV-1/ 2) jsou nejčastějšími sexuálně přenosných patogenů, které způsobují vředy v genitální, anální a orofaryngeální oblasti. Genitální vředy jsou významným rizikovým faktorem pro přenos a získání viru lidské imunodeficience (HIV). Identifikace patogenů způsobujících vředy je předpokladem účinné léčby a snížení rizika infekce HIV.
Genitální herpes může být způsobeno tím, že dvě velmi podobné viry, herpes simplex virus HSV-1 nebo HSV-2, je infekce způsobené první, kdo častěji. Herpes simplex virus (HSV) -1 a -2 jsou velké, dvouvláknové DNA viry, které způsobují celoživotní přetrvávající infekce charakterizované obdobími klidu a recidivujícím onemocněním. Tyto dva typy HSV nelze klinicky rozlišit. Ve skutečnosti sdílejí vysoký stupeň genetické homologie, ale mají také specifické oblasti s malými variacemi nukleotidů, které mohou umožnit diskriminaci. K infekci HSV-1 a HSV-2
dochází inokulací virových částic do citlivých povrchů sliznic. Poté, tyto neurotropní viry mohou stát skryté v místní senzorická ganglia, pravidelně reaktivace způsobit symptomatické léze, nebo projít bez příznaků virové vydání, s potenciálem pro přenos nemoci a infekce. Stejná léčba se používá jak u infekcí HSV-1, tak u infekcí HSV-2, umístění lézí a chronicita infekce (primární nebo rekurentní) určují dávkování a frekvenci.
spirochete Treponema pallidum (Tp), etiologické činidlo syfilisu, způsobuje vícestupňovou pohlavně přenosnou infekci (STI). Patogenní treponemes způsobují venerické syfilis, frambézie, endemické syfilis, pinty—vícestupňové, infekcí, které, i když podobné, mohou být rozlišeny na základě klinických, epidemiologických a geografických kritérií. Pouze pohlavní syfilis je přenášen sexuální aktivitou. Patogenní treponémy jsou nekultivovatelné, pomalérostoucí mikroorganismy s identickými morfologiemi plochých vln. Špatně snášejí vysychání, zvýšená teplota, a napětí okolního kyslíku, vlastnosti, které vysvětlují, proč efektivní přenos vyžaduje blízký osobní kontakt.
pro diagnostiku Treponema pallidum a viru herpes simplex typu 1 nebo 2 je k dispozici několik typů laboratorních testů. Sérologie, mikroskopie tmavého pole a PCR jsou zlatými standardy pro diagnostiku těchto patogenů. Ukázalo se však, že PCR testy v reálném čase jsou citlivějším a specifičtějším diagnostickým nástrojem pro jejich detekci.