Treponema pallidum og herpes virus type 1 eller 2 (HSV-1/ 2) er de mest almindelige seksuelt overførte patogener, der forårsager sår i kønsorganet, anal og oropharyngeal region. Genital sår er en væsentlig risikofaktor for overførsel og erhvervelse af human immundefektvirus (HIV). Identifikation af sårfremkaldende patogener er en forudsætning for en effektiv terapi og reducerer risikoen for HIV-infektion.
Genital herpes kan være forårsaget af to meget lignende vira, herpes virus HSV-1 eller HSV-2, der er infektioner forårsaget af den første oftere. Herpes virus (HSV) -1 og -2 er store, dobbeltstrengede DNA-vira, der forårsager livslang vedvarende infektioner karakteriseret ved perioder med ro og tilbagevendende sygdom. Disse to HSV-typer kan ikke skelnes klinisk. Faktisk deler de en høj grad af genetisk homologi, men de har også specifikke regioner med små nukleotidvariationer, som kan tillade forskelsbehandling. HSV-1 og HSV-2 infektion
sker via podning af viruspartikler i følsomme slimhindeoverflader. Bagefter kan disse neurotrope vira blive latente i den lokale sensoriske ganglion, periodisk reaktiveres for at forårsage symptomatiske læsioner eller gennemgå asymptomatisk viral frigivelse med potentiale for sygdomsoverførsel og infektion. Den samme behandling anvendes til både HSV-1 og HSV-2 infektioner, placeringen af læsionerne og infektionens kronicitet (primær eller tilbagevendende) bestemmer dosering og hyppighed.
spirochete Treponema pallidum (Tp), det etiologiske middel til syfilis, forårsager en flertrins seksuelt overført infektion (STI). Patogene treponemer forårsager veneral syfilis, gaber, endemisk syfilis, og pinta—multistage, infektioner, der, selvom de er ens, kan differentieres baseret på klinisk, epidemiologisk, og geografiske kriterier. Kun veneral syfilis overføres ved seksuel aktivitet. De patogene treponemer er ukultiverbare, langsomtvoksende mikroorganismer med identiske fladbølgemorfologier. De tolererer dårligt udtørring, forhøjet temperatur og omgivende iltspænding, træk, der forklarer, hvorfor effektiv transmission kræver tæt personlig kontakt.
Der findes flere typer laboratorietest til diagnosticering af Treponema pallidum og herpes virus type 1 eller 2. Serologi, mørk feltmikroskopi og PCR er guldstandarderne til diagnosticering af disse patogener. Imidlertid har realtids PCR-analyser vist sig at være et mere følsomt og specifikt diagnoseværktøj til deres påvisning.