Nelle settimane successive all’attacco a Pearl Harbor, Marshall assegnò a Clark due compiti che avrebbero potuto avere un impatto sulla decisione di incarcerare tutti i giapponesi americani sulla costa occidentale. In entrambi i casi, le sue conclusioni che direttamente o indirettamente si opponevano all’esclusione sono state in gran parte ignorate. In primo luogo, Marshall ha inviato Clark a visitare il Comando di difesa occidentale in risposta al suo comandante, la chiamata generale John DeWitt s’per più truppe con cui difendere la costa occidentale. Dopo cinque giorni di studio, ha riferito a Marshall il Gen. 27, 1942 che la designazione “teatro delle operazioni”(impostato il dic. 11) essere rimosso per ragioni tattiche, poiché ” tutto ciò che serve per proteggere la costa occidentale è un comando funzionale con la missione di difendere la frontiera costiera dalle incursioni aeree e navali di superficie.”DeWitt e l’esercito Provost maresciallo generale Allen Gullion obiettarono, in gran parte perché tale azione avrebbe messo in pericolo i loro sforzi per rimuovere tutti i giapponesi americani dalla costa occidentale.

Pochi giorni dopo, il febbraio. 3, ha testimoniato davanti a una commissione Camera-Senato sulla difesa della Costa occidentale presieduta dal Sen. Rufus Holman dell’Oregon. Insieme al capo delle operazioni navali Harold Stark, dichiarò che ” uno sforzo di invasione era fuori questione “e che il massimo di cui il nemico era capace sarebbe stato” avere un sottomarino che lanciasse qualche proiettile in qualche città che sarebbe stata un’operazione inutile dal punto di vista dei risultati pratici.”Il suo licenziamento della possibilità di un’invasione giapponese della costa occidentale era coerente con i rapporti dell’intelligence dell’esercito e apparentemente sottovalutava una delle principali motivazioni per l’esclusione di massa dei giapponesi americani.

Il secondo e correlato incarico di Clark era quello di indagare su cosa si doveva fare con i giapponesi americani sulla costa occidentale dal punto di vista di un pianificatore militare. All’inizio di febbraio del 1942, era giunto alla conclusione che la rimozione di massa dei giapponesi americani proposta da DeWitt e dai suoi consiglieri era mal consigliata e “espresse incredulità” quando DeWitt lo informò di questi piani il 12 febbraio. Citando le richieste di manodopera sull’esercito in uno scenario di rimozione di massa—credeva che da 10.000 a 15.000 soldati sarebbero stati tenuti a proteggere solo il gruppo alieno incarcerato—sosteneva invece di identificare “installazioni critiche” da proteggere sfrattando gli alieni nemici attorno al loro perimetro. Ha anche raccomandato che “i leader dell’anello e sospetti dovrebbero essere internati liberamente” e anche frequenti incursioni e contropropaganda. Ma la sua proposta più ragionata arrivò troppo tardi, poiché lo scenario di rimozione di massa più draconiano era già stato approvato dal presidente e Segretario alla guerra Henry Stimson , nessuno dei quali chiese le opinioni dei generali Clark o Marshall.

Nel gennaio del 1943, il tenente generale Clark fu nominato comandante della Quinta Armata e guidò l’offensiva alleata in Italia. Tra i soldati sotto il suo comando c’era il 100 ° Battaglione di fanteria, composto da giapponesi americani delle Hawaii. Inizialmente respinto dal generale Dwight D. Eisenhower, Clark li prese volentieri e presto divenne il loro “sostenitore più entusiasta”, citando la loro” efficienza “e” rapida reazione all’opposizione ostile ” nei loro incontri iniziali con il nemico. Nella sua autobiografia, ha ricordato che il 100 era”… uno dei beni più preziosi della Quinta Armata “e che” combatterono magnificamente per tutta la campagna d’Italia.”Le truppe di Nisei sembravano essere molto consapevoli del fatto che avevano l’opportunità di dimostrare la lealtà di molte migliaia di americani di ascendenza giapponese”, ha aggiunto, “e hanno pagato volentieri un prezzo elevato per raggiungere quell’obiettivo. Ero orgoglioso di averli nella Quinta Armata.”

Per le obiezioni di Clark, il 100 ° e il 442 ° Reggimento di combattimento (che incorporava il 100°) furono trasferiti in Francia per aiutare a prendere le Montagne dei Vosgi nel settembre del 1944. Nel tentativo di evitare ciò, propose a Marshall che il 100 ° fosse staccato dal 442 ° e rimanesse con lui, mentre il 442 ° sarebbe stato inviato in Francia, sostenendo che gli effetti pubblicitari sarebbero stati moltiplicati in tale scenario. “È difficile per me esagerare la corsa che ho sperimentato nell’avere il 100 ° battaglione di fanteria nella Quinta Armata”, ha scritto loro in una lettera d’addio. “Desidero esprimervi il mio sincero apprezzamento per il superbo lavoro che avete svolto e augurarvi ogni successo nelle vostre nuove imprese.”Più tardi, nell’aprile 1945, il 442nd tornò in Italia e servì sotto Clark—che era ora comandante del Quindicesimo Gruppo d’armate a capo di tutte le forze alleate in Italia—per il resto della guerra. Clark prese la resa tedesca dell’Italia il 2 maggio.