nazwa wciąż jednak cieszyła się dużym prestiżem, a Ayub Khan założył później nową partię, Konwentową Ligę muzułmańską. Frakcja opozycyjna stała się znana jako Rada Ligi Muzułmańskiej. To ostatnie ugrupowanie połączyło się w 1967 roku z innymi partiami politycznymi w opozycji do reżimu. Gdy jednak w grudniu 1971 upadł wojskowy reżim Agha Mohammada Yahya Khana i odbyły się pierwsze prawdziwie wolne wybory w Pakistanie, wojsko nie pozwoliło jednak na objęcie urzędu zwycięzcy większości. PPP Bhutto zostało wymazane z władzy: Pakistan Zachodni zdominowany przez pakistańską Partię Ludową Zulfikar Ali Bhutto przegrał masowo, a Awami League of East Pakistan mocno wygrała wybory pod wodzą Szejka Mujibura Rahmana. Większy spisek nie pozwolił jednak na zaprzysiężenie Ligi Awami. Wybuchła wojna i 26 marca 1971 Pakistan Wschodni stał się Ludową Republiką Bangladeszu.
Po 1971 w Pakistanie(Zachód) władzę przejęła PPP pod wodzą Zulfiqara Ali Bhutto. 1977 Bhutto został usunięty przez generała Ziaula Haqa w wyniku zamachu stanu. 1988, po śmierci wojskowego władcy Pakistanu, a później cywilnego prezydenta Muhammada Zia-ul-Haq, powstała nowa Liga Muzułmańska pod przywództwem Nawaza Szarifa, ale nie miała ona żadnego związku z pierwotną Ligą muzułmańską. Sharif był premierem w latach 1990-1993 i ponownie w latach 1997-1999, kiedy to został obalony w wyniku trzeciego wojskowego zamachu stanu w Pakistanie. W kontrowersyjnych wyborach przeprowadzonych przez reżim wojskowy Perveza Musharrafa w październiku pięć różnych partii używających nazwy Liga Muzułmańska zakwestionowało mandaty. Największa z nich, pakistańska Liga Muzułmańska (Quaid-e-Azam), zdobyła 69 mandatów z 272, A pakistańska Liga Muzułmańska (Nawaz), lojalna Nawazowi Sharifowi, zdobyła 19 mandatów. Po wyborach w 2008 Liga Quaid-e-Azam znalazła się w rządzącej koalicji, A Liga Muzułmańska Nawaz Szarif znalazła się w opozycji. W ostatnich wyborach w 2013 roku pakistańska Liga Muzułmańska (Nawaz) stała się największą partią w kraju; partia utworzyła swój rząd w centrum, a Nawaz Sharif został ponownie wybrany na trzecią kadencję jako premier Pakistanu.
obecne frakcje reaktywowanej partii
- Pakistan Muslim League (N) (Nawaz)
- Pakistan Muslim League (Q) (Grupa Quaid-e-Azam)
- Pakistan Muslim League (F) (funkcjonalna)
- Pakistan Muslim League (Z) (Zia-ul-Haq Shaheed)
- Awami Muslim Liga
- All Pakistan Muslim League