istnieje niewiele najnowszych publikacji dotyczących stosowania antybiotyków w uprawach, a te, które istnieją, często przytaczają artykuły przeglądowe, które odnoszą się do wcześniejszych źródeł. Literatura opisująca współczesne stosowanie antybiotyków na roślinach zwykle ogranicza się do literatury rozszerzającej (https://extension.psu.edu/pear-disease-fire-blight) lub zgłasza obawy dotyczące rozwoju oporności na antybiotyki w populacjach patogenów roślin (Sundin and Wang 2018; Farfán et al. 2014). Wyjątki od tego są dwa ostatnie dokumenty z Chin, które zapewniają pewne wgląd w antybiotyki są zalecane przez usługi rozszerzenia w kraju (Zhang et al. 2017; Wan et al. 2019). Dokumenty te wykorzystują informacje pochodzące z klinik roślinnych w Chinach i sugerują, że antybiotyki pojawiają się między 2,5 A 4,5% zaleceń.

dane generowane przez kliniki Plantwise są unikalne, ponieważ pochodzą od „oddolnych” doradców rolnych, z których większość jest zatrudniona przez ministerstwa rolnictwa. W przeciwieństwie do danych dotyczących sprzedaży pestycydów, informacje te dają wgląd w wiedzę doradców rolnych i jakie opcje zarządzania są rutynowo podawane małym rolnikom w krajach o niskich i średnich dochodach (Lmic). Zbiór danych jest znaczny, obejmuje 32 kraje i ponad 400 000 zaleceń. Należy zachować ostrożność przy wyciąganiu wniosków na temat stosowania antybiotyków przez rolników, ponieważ baza danych POMS zawiera zalecenia dla rolników i niekoniecznie odzwierciedla zachowanie rolników. W tym badaniu nie podjęto próby oceny, jaki poziom zaleceń są wdrażane przez rolników, chociaż wcześniejsze badania w Plantwise sugerują, że wskaźniki przyjmowania porad przez rolników uczęszczających do klinik, w szczególności w zakresie środków kontroli chemicznej, są wysokie (Silvestri et al. 2019). Pomimo tego zastrzeżenia, dane te wydają się wskazywać, że stosowanie antybiotyków w produkcji roślinnej jest szersze niż sugerowałaby większość literatury. Biorąc pod uwagę brak innych źródeł informacji, w szczególności z Lmic, uważamy, że baza danych Plantwise POMS jest ważnym zasobem w ocenie poziomu stosowania antybiotyków w krajach, w których nie jest monitorowana, a przepisy są minimalne lub nie są egzekwowane.

Zakres stosowania antybiotyków

obliczenia globalnego stosowania antybiotyków w uprawach opierają się prawie wyłącznie na danych uzyskanych z USA przeciwko zarazie pożarowej spowodowanej przez Erwinia amylovora na jabłkach i gruszkach (Gusberti et al. 2015; McManus 2014; Vidaver 2002; McManus and Stockwell 2000). Literatura ta sugeruje, że ilość antybiotyków stosowanych w uprawach w USA jest stosunkowo niska w porównaniu z ilościami stosowanymi w hodowlach i akwakulturze, z szacunkami w zakresie od 0,26% do 0,5% całkowitego spożycia antybiotyków rolniczych (McManus et al. 2002; McManus 2014). Doprowadziło to autorów do wniosku, że ograniczenie stosowania antybiotyków w uprawach nie doprowadziłoby do znacznego ograniczenia stosowania na świecie (FAO i WHO 2019a). Jednak brak programów nadzoru, w wielu krajach, w połączeniu z brakiem dokumentacji aplikacji, udaremnia wszelkie próby oszacowania rzeczywistych ilości antybiotyków stosowanych. Tam, gdzie przeprowadzono dogłębne badania, wyniki mogą być zaskakujące. W Kostaryce zasugerowano, że ilości tetracykliny i gentamycyny stosowane w uprawach mogą być 200-700 razy większe niż ilości stosowane w medycynie (Rodríguez Sánchez 2008).

w całym tym badaniu dane są podzielone na regiony w oparciu o system klasyfikacji WHO, a kraje nie są identyfikowane indywidualnie, aby chronić tożsamość narodową, zapewniając jednocześnie pewien wgląd w stosowanie antybiotyków. Nie tylko istnieją skrajne różnice między regionami, jak wynika z przedstawionych wyników (Afryka bez użycia w ogóle i morze z prawie 2,5% wszystkich zaleceń zawierających antybiotyk), ale istnieje ogromna różnica w ilości antybiotyków stosowanych przez różne kraje w regionach; dane nie zostały ujawnione. Regionalne i krajowe różnice w zaleceniach dotyczących antybiotyków mogą wynikać z cen, przepisów, dostępności produktów, reżimów uprawy, wiedzy doradców agronomicznych lub natury czynników chorobotwórczych, które stanowią problem. Można tylko spekulować, która kombinacja tych czynników powoduje różnicę w stosowaniu antybiotyków.

Sundin i Wang (2018) sugerują, że antybiotyki nie są szerzej stosowane ze względu na związane z tym koszty, ale wydaje się, że nie ma to miejsca, ponieważ masowe koszty tetracykliny i streptomycyny są dostępne odpowiednio w cenie 10 USD i 1 USD za kilogram, podobnej cenie do tlenochlorku miedzi (oksychlorek miedzi). Alibaba.com cena aktualna na 2019 rok). Warto jednak zauważyć, że w ramach zestawu danych nie ma antybiotyków zalecanych w krajach afrykańskich.

patogeny bakteryjne są obecne na całym świecie i we wszystkich uprawach. Biorąc pod uwagę różnorodność upraw i systemów upraw stosowanych na całym kontynencie afrykańskim, uważa się za mało prawdopodobne, aby rodzaje patogenów spotykanych w Afryce były wystarczająco różne od reszty świata. W wielu Lmic, w tym w Afryce, antybiotyki są swobodnie dostępne poprzez nieuregulowane łańcuchy dostaw i sprzedaż bez recepty. Jest zatem mało prawdopodobne, aby rozbieżność w stosowaniu antybiotyków w Afryce w porównaniu z innymi regionami świata wynikała z ich niedostępności. Wskazywałoby to, że niektóre inne czynniki zapobiegają(lub ograniczają) stosowaniu antybiotyków w tym regionie. W Chinach stosowanie antybiotyków w produkcji roślinnej jest wyższe niż odnotowane w naszych danych (Zhang et al. 2017). Spośród zaleceń sformułowanych przez pracowników spółdzielni, 4,5% z nich zawierało antybiotyk (Zhang et al. 2017). Stosowanie antybiotyków w uprawach w Chinach jest przynajmniej częściowo napędzane przez dotacje rządowe mające na celu promowanie ich stosowania (Zhang et al. 2017).

na jakich uprawach stosuje się antybiotyki ?

z danych wynika, że ryż dominuje w uprawach, na których zaleca się stosowanie antybiotyków i nie jest możliwe określenie, czy wynika to z charakteru uprawy, czy z krajów, w których jest uprawiany. Przeważająca liczba zaleceń dotyczących ryżu w morzu, zawierających antybiotyki, przeważa nad regionalnymi różnicami w danych. W morzu 7,4% zaleceń dotyczących ryżu okazało się zawierać antybiotyk, a w niektórych latach było to prawie 10%. Po usunięciu ryżu z obliczeń odsetek zaleceń zawierających antybiotyk w morzu zmniejszył się do znacznie skromniejszego 0,6%. Kolejnym największym konsumentem antybiotyków są Ameryka Z 1,62% wszystkich zaleceń zawierających antybiotyk, pomimo braku ryżu w danych POMS. Wydaje się, że z jakiegoś powodu stosowanie antybiotyków na ryż w morzu jest płodne w stosunku do innych obszarów uprawy ryżu i innych upraw. Jednak pracownicy naukowi w jednym kraju morskim twierdzą, że stosowanie antybiotyków na ryżu jest stosunkowo niewielkie i jest karłowate przez stosowanie antybiotyków na roślinach ozdobnych do celów religijnych. Pozostałość tetracykliny była widoczna na róży podczas ostatniej wizyty w tym regionie przez głównego autora (rys. 2).

jakie antybiotyki są stosowane?

18 nazw handlowych antybiotyków w zbiorze danych POMS to tylko ułamek dostępnych w leczeniu chorób roślin uprawnych w wielu częściach świata (zwłaszcza w regionie WP). Spośród jedenastu antybiotyków zawartych w danych, 6 z nich (streptomycyna, tetracyklina, Oksytetracyklina, gentamycyna, cefadroksyl, amoksycylina) uważa się za krytycznie ważne środki przeciwdrobnoustrojowe w medycynie ludzkiej zgodnie z definicją WHO (Światowa Organizacja Zdrowia 2019). Inne antybiotyki (kwas oksolinowy, kasugamycyna, ningnanmycyna, walidamycyna i aureofungina) są ograniczone do stosowania w Warunkach rolniczych przeciwko bakteryjnym, aw niektórych przypadkach chorobom grzybiczym.

różnice regionalne

nasze wyniki potwierdzają, że z innych, wskazując, że streptomycyna jest najczęściej stosowanym antybiotykiem na roślinach uprawnych (McManus 2014; Zhang et al. 2017) z tetracykliną i kasugamycyną na drugiej i trzeciej pozycji. Co ciekawe, antybiotyk zhongshengmycin, nie pojawia się w naszych danych, mimo że jest drugim najczęściej zalecanym antybiotykiem w chińskich klinikach roślinnych (ponad jedna czwarta zaleceń dotyczących antybiotyków) (Zhang et al. 2017).

Kasugamycyna była szeroko stosowana we wszystkich regionach, ale stosowanie innych antybiotyków wykazuje znaczne zróżnicowanie regionalne, przy czym sześć z 11 antybiotyków pojawia się tylko w jednym regionie. Pomimo dużej liczby zapisów z Morza, tylko 3 antybiotyki stanowią większość danych (99%), a mianowicie kasugamycyna, streptomycyna i tetracyklina. Prawie cała kasugamycyna stosowana w morzu była na ryżu (tylko 14% na uprawach innych niż ryż), a mimo to kasugamycyna była antybiotykiem z wyboru w Ameryce (72% wszystkich zapisów zawierających antybiotyk), jednak w danych z obu Ameryk nie ma zapisów dotyczących przywiezienia ryżu do klinik.

inne antybiotyki wykazują podobne regionalne ograniczenia, na przykład kwas oksolinowy był stosowany w WP (35% wszystkich zaleceń dotyczących antybiotyków), ale nigdzie indziej, podobnie w morzu 38% zaleceń zawiera tetracyklinę, jednak antybiotyk ten pojawia się tylko trzykrotnie poza tym regionem. Rzeczywiście, spekulujemy, że zapisy „tetracykliny” na obszarach poza morzem są w rzeczywistości skrótem „oksytetracykliny”.

uważa się za mało prawdopodobne, aby Regionalne zróżnicowanie antybiotyków wynikało z ich specyficzności wobec chorób bakteryjnych regionu. Jednak oporność na antybiotyk może napędzać niektóre różnice, ponieważ rolnicy zwracają się do alternatyw, gdy produkty stają się nieskuteczne (Manulis et al. 1999; Goodman 1980). Alternatywnie, różnice regionalne mogą być spowodowane wstępnym wyborem producentów, zakładami produkcyjnymi i wprowadzaniem do obrotu. Ogromna zmienność (rzędy wielkości) w stosowaniu antybiotyków między podobnymi krajami, które graniczą ze sobą (DANE Nie pokazane) jest interesująca sama w sobie, ale rzuca również wątpliwości co do zasadności ekstrapolacji stosowania antybiotyków z jednego kraju do drugiego (Van Boeckel et al. 2015).

na jakie problemy zaleca się stosowanie antybiotyków?

antybiotyki są zwykle stosowane przeciwko patogenom bakteryjnym zarówno w warunkach medycznych, jak i weterynaryjnych. W oparciu o pisemną diagnozę około 60% diagnoz dotyczyło nazwanej bakterii lub choroby bakteryjnej (64% w oparciu o pola wyboru). Uzasadnione jest założenie, że w większości tych przypadków stosowanie antybiotyków byłoby korzystne dla zdrowia upraw, ale w 6% przypadków, w których diagnoza była „więdnięcie bakteryjne”, leczenie antybiotykami w sprayu nie przyniosłoby żadnego efektu.

drugą co do wielkości kategorią organizmów, w których zalecano antybiotyki, były owady i/lub roztocza 12% (18% w oparciu o pola wyboru). Jest to zaskakujące, ponieważ antybiotyki nie działają przeciwko stawonogom. Stosowanie antybiotyków przeciwko owadom i roztoczom jest szczególnie rozpowszechnione w morzu, które stanowiło ponad 90% zaleceń antybiotykowych przeciwko tej grupie. Oprócz działania przeciwbakteryjnego niektóre antybiotyki, w tym streptomycyna, kasugamycyna, aureofungina, ningnanmycyna, kwas oksolinowy i walidamycyna, wykazują aktywność przeciwko innym grupom patogenów, w tym grzybom (Vallad et al. 2010; Lee et al. 2005), formy wodne (Tso i Jeffrey 1956) i wirusy (Han et al. 2014).

antybiotyki były zalecane do leczenia problemów grzybiczych we wszystkich czterech regionach, jednak praktyka ta była najbardziej rozpowszechniona w regionach EM i SEA, gdzie 33% i 17% zapisów zawierających antybiotyk było przeciwko celom grzybiczym odpowiednio. Nie jest możliwe określenie, w jakim stopniu doradcy rolni są świadomi działania przeciwgrzybiczego niektórych antybiotyków, ale istnieją dowody na podstawie danych sugerujące świadomość co najmniej niektórych kombinacji czynników chorobotwórczych z uprawami. Przykładem tego było zastosowanie aureofunginy do kontroli Ganodermy (patogenu grzybowego) w kokosie. Antybiotyk ten ma działanie przeciwgrzybicze i jest ustaloną praktyką postępowania w tej chorobie (Kandan et al. 2010). W SEA wszystkie z wyjątkiem dwóch rekordów z aureofunginą były dla zarządzania Ganoderma.

Kasugamycyna jest antybiotykiem rolniczym pierwotnie opracowanym do stosowania w ryżu o działaniu przeciwko chorobie grzybiczej ryżu (Mangnaporthe oryzae). W morzu, gdy kasugamycyna była zalecana przeciwko problemowi grzybiczemu, była prawie wyłącznie przeciwko blastowi ryżu, podczas gdy antybiotyk ten nie był zalecany przeciwko chorobom grzybowym ryżu w żadnym innym regionie. Streptomycynę i tetracyklinę zalecano również przeciw wybuchowi ryżu w morzu, mimo że nie miały one wpływu na tę chorobę, być może wskazując na niezrozumienie właściwości tych dwóch antybiotyków.

powszechne jest błędne przekonanie w medycynie ludzkiej, że antybiotyki mogą zabijać wirusy (Jordan 2014), ale wydaje się, że nie przekłada się to na zalecenia dotyczące produkcji roślinnej. Na podstawie pól wyboru, 4.4% wszystkich zapisów w całym zbiorze danych (nie tylko tych, dla których zalecono antybiotyk) dotyczy wyłącznie choroby wirusowej, podczas gdy z zapisów, które zawierają antybiotyk w zaleceniu, tylko 0,54% uważa się za spowodowane przez wirus. Co ciekawe, antybiotyk ningnanmycyna w badaniach eksperymentalnych wykazał pewną aktywność przeciwwirusową (Han i wsp . 2014). Jednak w naszych danych ningnanmycin został ograniczony do stosunkowo niewielu rekordów w regionie Morza i żaden z nich nie był przeciwko problemom wirusowym. Oczywiste jest, że w niektórych przypadkach antybiotyki są skutecznie stosowane przeciwko celom niebakteryjnym, jednak ich rozrzutne stosowanie może prowadzić do wniosku, że doradcy rolni nie są świadomi ich ograniczonego spektrum działania. Zaobserwowano jednak, że w wielu przypadkach, zwłaszcza w morzu, zalecenia były identyczne niezależnie od diagnozy. Spekulujemy, że doradcy rolni w SEA rutynowo łączą środek owadobójczy z fungicydem i antybiotykiem w jednym zastosowaniu, aby poradzić sobie z bieżącym problemem i zapobiec/kontrolować inne problemy, które jeszcze nie występują lub występują na niskim poziomie.

stopień zaawansowania rozwoju i obszar leczony antybiotykami

celem programu Plantwise jest pomoc doradcom drobnych rolników i tak właśnie było, ponieważ wielkość powierzchni, do której odnoszą się zalecenia, wynosiła średnio 0,6 Ha. Średni obszar nie jest cytowany, ponieważ jest potencjalnie mylący ze względu na to, co wydaje się być błędnie umieszczonymi punktami dziesiętnymi na formach plantwise. Antybiotyki są stosowane w uprawach w połowie ich produkcji, ponieważ zdecydowana większość antybiotyków była stosowana w uprawach, które były w „pośrednim” etapie wzrostu i były stosowane do „liści” roślin. Mniej niż 5% zapisów związanych z obróbką sadzonek. Co ciekawe, pięć rekordów zalecało stosowanie antybiotyków po zbiorze, co oczywiście budzi obawy konsumentów dotyczące poziomów pozostałości. Biorąc pod uwagę nasilenie ataku, 96% zapisów wskazywało, że zdiagnozowany problem dotyka co najmniej jednej czwartej stanowiska uprawnego, co wskazuje, że antybiotyki są stosowane przed rozpowszechnieniem się problemu.

dawki antybiotyku

stężenie zastosowanego antybiotyku i rzeczywista dawka otrzymywana przez liście zależy od ilości wody użytej do rozcieńczenia koncentratu, ponieważ odpływ wkrótce zostanie osiągnięty, jeśli plon był młody lub jeśli objętość oprysku była zbyt duża. Nie wpłynie to jednak na całkowitą ilość antybiotyku rozpylanego do środowiska. Aby oszacować ilość stosowanych antybiotyków, warto wybrać plon i region i dokładniej zbadać, ile produktu jest nakładany. W regionie Morza 7,4% wszystkich zaleceń dotyczących ryżu zawierało antybiotyk. Plantomycyna (najczęściej zalecany antybiotyk w regionie) jest mieszaniną streptomycyny i tetracykliny. Na podstawie tych obliczeń przyjęto, że zalecaną stawkę stosuje się do 7.4% całego obszaru uprawy ryżu w regionie (szacowany na ponad 75 mln Ha (http://ricestat.irri.org:8080/wrsv3/entrypoint.htm)). Gdyby tak było, pojedynczy wniosek oznaczałby ponad 63 Tony streptomycyny i 7 ton tetracykliny. Może to być niedoszacowane, ponieważ zalecana przez producentów dawka jest często podwajana przez doradców rolniczych.

te dane są tylko małą migawką zastosowań chemicznych, a ilości te są stosunkowo niewielkie w porównaniu z sektorem hodowli zwierząt, ale mimo to znaczące, zwłaszcza gdy rozważa się ich los środowiskowy.

jakie inne metody zwalczania są stosowane przeciwko bakteryjnym patogenom roślin?

w przeciwieństwie do ogromnego arsenału substancji chemicznych aktywnych przeciwko grzybom i pleśniom wodnym (85 w całym zbiorze danych), jest stosunkowo niewiele substancji chemicznych, które są skuteczne w zmniejszaniu chorób bakteryjnych. Niektóre fungicydy, takie jak mankozeb, mają ograniczone działanie przeciwko chorobom bakteryjnym i istnieją specjalistyczne związki bakteriobójcze, takie jak Bronopol i Bismertiazol, ale na podstawie naszych danych nie są one powszechnie stosowane. Bismertiazol jest często mieszany z antybiotykami, w rzeczywistości istnieje 6 produktów dostępnych w handlu w Wietnamie, które zawierają Bismertiazol mieszany z antybiotykami (Noghiệp bộ nông và phát triần nông thôn 2016).

nasze dane sugerują, że zdecydowanie najczęściej stosowanymi substancjami chemicznymi przeciwko chorobom bakteryjnym są sole miedzi. W całym zbiorze danych ponad 13% rekordów, które mają zaznaczone pole wyboru „bakteryjne”, ma słowo” miedź ” w rekomendacji. Jest to jednak znaczna niedoszacowanie produktów na bazie miedzi, ponieważ wiele z nich jest zalecanych tylko pod nazwą handlową lub jako”mieszanka Bordeaux”. Odsetek zapisów zawierających antybiotyk i słowo „miedź” wynosi 21% (ponownie niedoszacowany). Często sole miedzi są wstępnie mieszane z antybiotykami, a w samym Wietnamie istnieje ponad 9 produktów (nie przedstawionych w zbiorze danych POMS), które są antybakteryjnymi substancjami chemicznymi zawierającymi mieszankę antybiotyków i soli miedzi (Noghiệp bộ nông và phát triần nông thôn 2016).

sole miedzi są bardzo szeroko stosowanym składnikiem aktywnym, popularnym wśród doradców rolniczych, ponieważ są powszechnie dostępne i aktywne przeciwko grzybicom, pleśniom wodnym i chorobom bakteryjnym. Te właściwości przeciwdrobnoustrojowe sprawiają, że jest to popularny wybór wśród doradców rolniczych, zwłaszcza jeśli nie są w stanie postawić ostatecznej diagnozy, ponieważ produkt zawierający miedź będzie miał korzystny wpływ na wszystkie te klasy patogenów.

rozprzestrzenianie się oporności na antybiotyki na patogeny zwierzęce i ludzkie

istnieje duże zaniepokojenie stosowaniem antybiotyków w rolnictwie ze względu na możliwość rozprzestrzeniania się oporności na ważne z medycznego punktu widzenia bakterie. Większość obaw opiera się na stosowaniu antybiotyków w hodowli zwierząt, a stosowanie w produkcji roślinnej w dużej mierze nie zostało skomentowane, prawdopodobnie dlatego, że uważa się, że stosowanie jest bardzo niskie w porównaniu z ilościami stosowanymi u zwierząt gospodarskich lub dlatego, że społeczność medyczna nie była świadoma ich stosowania w tym zakresie. Przepisy dotyczące stosowania antybiotyków na roślinach różnią się znacznie między krajami i regionami. Unia Europejska i Brazylia Nie zatwierdzają żadnych antybiotyków jako aktywnych składników pestycydów (Donley 2019), podczas gdy niektóre kraje zezwalają na ich stosowanie w przypadku niektórych upraw lub w sytuacjach awaryjnych, inne nie mają żadnych przepisów w tym zakresie. Ponadto wiele krajów Morza Śródziemnego i WP uważa stosowanie antybiotyków w produkcji roślinnej za ważny środek zwalczania patogenów, jednocześnie chroniąc środowisko.

dopiero niedawno organizacje międzynarodowe, takie jak FAO i WHO, zaczęły budzić obawy dotyczące stosowania antybiotyków w leczeniu chorób roślin uprawnych. Na niedawnym wspólnym posiedzeniu w sprawie zarządzania pestycydami sformułowano zalecenie, aby antybiotyki stosowane dla zdrowia ludzi i zwierząt nie były rejestrowane jako pestycydy (FAO i WHO 2019b). Obawy te dotyczą stosowania antybiotyków wywołujących presję selekcji w środowisku upraw, które przyspiesza rozprzestrzenianie się oporności na antybiotyki z bakterii glebowych na ludzkie patogeny. Jednak nie określono jeszcze pełnego zakresu, w jakim stosowanie antybiotyków w tych systemach przyspiesza powstawanie oporności na antybiotyki u odzwierzęcych patogenów obecnych na uprawach (FAO i WHO 2019c).

istnieją jednak dobre dowody sugerujące, że rośliny (zwłaszcza te spożywane na surowo) są potencjalnym nośnikiem opornych bakterii do przedostania się do ludzkich jelit (Boehme et al. 2004; Hassan et al. 2011; Raphael et al. 2011; Rodríguez et al. 2006; Ruimy et al. 2010; Schwaiger et al. 2011; Walia et al. 2013). Niektórzy autorzy sugerują nawet, że te oporne bakterie mogą być źródłem materiału genetycznego do bocznego transferu genów po spożyciu, powodując oporne na antybiotyki patogeny w jelitach (Bezanson et al. 2008).

unikalnym aspektem stosowania antybiotyków w uprawach jest to, że są one rutynowo mieszane z innymi środkami agrochemicznymi. To zastosowanie doprowadziło do obaw dotyczących interakcji, które mogą promować oporność krzyżową lub współbrakcję oporności na antybiotyki. Jedno z badań wykazało, że bakterie rozwijają oporność na antybiotyki do 100 000 razy szybciej, gdy są narażone na niektóre herbicydy / mieszaniny antybiotyków w stosunku do ekspozycji na same antybiotyki (Kurenbach et al. 2018). Wstępnie wymieszane lub mieszanki antybiotyków i soli miedzi na farmie podobnie dają powody do niepokoju, ponieważ gleby społeczności bakteryjne z gleby zanieczyszczonej miedzią były znacznie bardziej tolerancyjne na wankomycynę i tetracyklinę niż kontrolujące gleby społeczności bakteryjne (Pal et al. 2015). Dodatkowo, bakterie zawierające geny nadające oporność na niektóre jony metali, w tym miedź, są znacznie bardziej prawdopodobne, że mają również geny oporności na antybiotyki w porównaniu z bakteriami bez genów oporności na metale (Pal et al. 2015). Tak więc, pomimo stosunkowo małych ilości antybiotyków stosowanych w produkcji roślinnej, ich stosowanie w połączeniu z innymi produktami produkcji roślinnej stanowi potencjalnie ważny czynnik ryzyka dla selekcji i rozpowszechniania opornych mikroorganizmów i genów z roślin na ludzi i zwierzęta.

ci, którzy opowiadają się za stosowaniem antybiotyków do zwalczania chorób roślin, zwracają uwagę, że nie ma udowodnionych dowodów na rozprzestrzenianie się odporności z bakterii chorobotwórczych roślin na patogeny ludzkie lub zwierzęce, pomimo ponad 50 lat ciągłego stosowania. Rzeczywiście jedno z badań donosi, że odsetek bakterii opornych na antybiotyki był większy w sadzie, który nie został spryskany antybiotykami, w porównaniu do tego, który otrzymał regularne spraye antybiotykowe (Yashiro and McManus 2012).