exotiska arter hotar inhemska arter
invasiva arter kan ändra ekosystemens funktioner. Till exempel kan invasiva växter förändra brandregimen, näringscykling och hydrologi i inhemska ekosystem. Invasiva arter som är nära besläktade med sällsynta inhemska arter har potential att hybridisera med de inhemska arterna. Skadliga effekter av hybridisering har lett till en nedgång och till och med utrotning av inhemska arter. Till exempel hotar hybridisering med introducerad cordgrass, Spartina alterniflora, förekomsten av Kalifornien cordgrass i San Francisco Bay. Invasiva arter orsakar konkurrens om inhemska arter. Fyra hundra av de 958 hotade arterna enligt lagen om hotade arter är i fara på grund av denna tävling.
sjöar och öar är särskilt utsatta för utrotningshot från införda arter. I Victoriasjön, som tidigare nämnts, var den avsiktliga introduktionen av Nilen abborre till stor del ansvarig för utrotningen av cirka 200 arter av ciklider. Den oavsiktliga introduktionen av den bruna trädslangen via flygplan från Salomonöarna till Guam 1950 har lett till utrotning av tre fågelarter och tre till fem arter av reptiler endemiska till ön. Flera andra arter är fortfarande hotade. Brown tree snake är skicklig på att utnyttja mänsklig transport som ett sätt att migrera; en hittades till och med på ett flygplan som anlände till Corpus Christi, Texas. Konstant vaksamhet från flygplats, militär och kommersiell flygplanspersonal krävs för att förhindra att ormen flyttar från Guam till andra öar i Stilla havet, särskilt Hawaii. Öar utgör inte ett stort landområde på jorden, men de innehåller ett oproportionerligt antal endemiska arter på grund av deras isolering från förfäderna på fastlandet.
det verkar nu som om den globala nedgången i amfibiearter som erkändes på 1990-talet till viss del orsakas av svampen Batrachochytrium Dendrobatidis, vilket orsakar sjukdomen chytridiomycosis. Det finns bevis för att svampen, infödd i Afrika, kan ha spridits över hela världen genom transport av en vanligt använd laboratorie-och husdjursarter: den afrikanska klöda padden (Xenopus laevis). Det kan mycket väl vara så att biologerna själva ansvarar för att sprida denna sjukdom över hela världen. Den nordamerikanska bullfrog, Rana catesbeiana, som också har introducerats allmänt som ett livsmedelsdjur, men som lätt flyr fångenskap, överlever de flesta infektioner av Batrachochytriumdendrobatidis och kan fungera som en reservoar för sjukdomen.