Treponema pallidum och herpes simplexvirus typ 1 eller 2 (HSV-1/ 2) är de vanligaste sexuellt överförda patogenerna som orsakar sår i köns -, anal-och orofaryngealregionen. Genitala sår är en signifikant riskfaktor för överföring och förvärv av humant immunbristvirus (HIV). Identifiering av sårframkallande patogener är en förutsättning för en effektiv terapi och minskar risken för HIV-infektion.

Genital herpes kan orsakas av två mycket liknande virus, herpes simplexvirus HSV-1 eller HSV-2, som är de infektioner som orsakas av första oftare. Herpes simplexvirus (HSV) -1 och -2 är stora, dubbelsträngade DNA-virus som orsakar livslånga ihållande infektioner som kännetecknas av perioder av lugn och återkommande sjukdom. Dessa två HSV-typer kan inte särskiljas kliniskt. Faktum är att de delar en hög grad av genetisk homologi, men de har också specifika regioner med små nukleotidvariationer som kan tillåta diskriminering. HSV-1 och HSV-2-infektion
sker via inokulering av viruspartiklar i känsliga slemhinneytor. Därefter kan dessa neurotropa virus bli latenta i den lokala sensoriska ganglionen, periodiskt återaktiveras för att orsaka symtomatiska lesioner eller genomgå asymptomatisk viral frisättning, med potential för sjukdomsöverföring och infektion. Samma behandling används för både HSV-1 och HSV-2-infektioner, platsen för lesionerna och infektionens kronicitet (primär eller återkommande) bestämmer dosering och frekvens.

spirochete Treponema pallidum (Tp), det etiologiska medlet för syfilis, orsakar en flerstegs sexuellt överförd infektion (STI). Patogena treponemer orsakar veneral syfilis, yaws, endemisk syfilis och pinta—flerstegsinfektioner som, även om de är liknande, kan differentieras baserat på kliniska, epidemiologiska och geografiska kriterier. Endast veneral syfilis överförs genom sexuell aktivitet. De patogena treponemerna är odlings -, långsamväxande mikroorganismer med identiska plattvågsmorfologier. De tolererar dåligt uttorkning, förhöjd temperatur och omgivande syrespänning, egenskaper som förklarar varför effektiv överföring kräver nära personlig kontakt.

flera typer av laboratorietester finns tillgängliga för diagnos av Treponema pallidum och herpes simplexvirus typ 1 eller 2. Serologi, mörk fältmikroskopi och PCR är guldstandarderna för att diagnostisera dessa patogener. PCR-analyser i realtid har dock visat sig vara ett mer känsligt och specifikt diagnosverktyg för deras upptäckt.