Al carecer de defensa natural, el control inglés continuo de Calais dependía de fortificaciones mantenidas y construidas a algún costo. Cerca de Calais, las fuerzas franco-borgoñonas se enfrentaban con frecuencia a las fuerzas de guarnición inglesas y al Ducado de Borgoña. Aliviado por la larga confrontación entre Borgoña y Francia, el dominio inglés sobre Calais pudo florecer durante 150 años. Los franceses y los borgoñones codiciaban la ciudad, pero preferían verla bajo los ingleses en lugar de su rival.

El 1 de enero de 1558, la vanguardia francesa invirtió Sangatte, Fréthun y Nielles, y el Cuerpo de Ejército redujo Fort Risban al día siguiente. El 3 de enero, la artillería se trasladó al Fuerte Nieulay en Rysbank. Thomas, Lord Wentworth, completamente abrumado por un ataque relámpago, entregó las llaves de la ciudad a los franceses el 7 de enero. El botín tomado por los franceses era más de lo que esperaban: comida para tres meses y casi 300 cañones. Las defensas inglesas de Guînes y Hames pronto también cayeron. Enrique II de Francia llegó a Calais el 23 de enero de 1558. Francia había reconquistado el último territorio que había perdido en la Guerra de los Cien Años y había puesto fin a dos siglos de lucha entre Inglaterra y Francia. La nueva administración francesa hizo una demarcación particularmente eficiente de la frontera, creó una nueva división de tierras de cultivo, reorganizó las 24 parroquias y reconstruyó aldeas e iglesias. No hubo ningún daño para los residentes ingleses: después de una noche bastante incómoda, fueron escoltados a los botes que los esperaban y se les dio un paso seguro a través del Canal de la Mancha.

En Inglaterra hubo conmoción e incredulidad por la pérdida de este último territorio continental. Cuenta la historia que unos meses después, la Reina María, en su lecho de muerte, dijo a sus damas: «Cuando esté muerta y abierta, encontrarán a Felipe y Calais inscritos en mi corazón.»