El Club Sphinx surgió de una pequeña sociedad secreta fundada en 1897. Originalmente conocido por varios nombres, en 1900, casi todos los miembros de esta organización se unieron para formar el Club Sphinx, ubicado en 1172 Massachusetts Avenue, entonces 55 Mt. Auburn Street. En 1903 el Club se trasladó a 72 Mt. Auburn Street, el sitio actual del Club Phoenix-S K.
El Club Kalumet fue fundado por miembros del capítulo de Harvard de Beta Theta Pi, muchos de la clase de 1900, y ocupó una pequeña casa en el actual sitio de construcción de Harvard Lampoon en Mt. Auburn Street. En 1900, el Club fue formalmente organizado como el Club Kalumet, y se trasladó a 1178 Massachusetts Avenue. En 1901 se trasladó a 104 Mt. Auburn Street, luego tres años más tarde se trasladó de nuevo al 44 Church Street, donde permaneció hasta su fusión con la Esfinge en 1914.
La adopción del Acuerdo entre Clubes y otras condiciones hizo deseable la unión de estos dos Clubes, por lo que en 1914, los miembros de ambos clubes votaron que sus membresías de pregrado debían unirse al nuevo Club S K. Se inició la construcción de una nueva casa club en el sitio de la casa de la Esfinge a 72 Mt. Auburn Street, y la casa Kalumet se emplearon mientras tanto. El nuevo edificio se inauguró formalmente el 1 de abril de 1916.
El Club Phoenix fue fundado en 1902 por un grupo de hombres que eran miembros de Theta Nu Epsilon, una sociedad nacional de segundo año formada originalmente como una rama de Skull and Bones de la Universidad de Yale. El Capítulo Alfa Eta de Theta Nu Epsilon fue fletado en 1895. Los miembros de T. N. E. organizó el Club Phoenix con fines residenciales y gastronómicos, pero mantuvo lazos como el Capítulo Alfa Eta con el resto de la sociedad hasta 1913, cuando hubo una división de esa sociedad. No se sabe cuándo los miembros del Club Phoenix dejaron de reunirse como miembros de Theta Nu Épsilon. A partir de 1902, el Club Phoenix ocupó una serie de casas, comenzando con la Casa John Hicks en 64 Dunster Street, y luego en 1906 se trasladó a 97 Mt. Auburn Street, luego en 1920 se trasladó de nuevo a la esquina noreste de las calles Winthrop y Holyoke.
En 1925, se iniciaron las negociaciones para la fusión del Phoenix y el Sk, y en enero de 1925, los órganos de pregrado de ambos clubes votaron su aprobación. Se formó un nuevo club, el Phoenix-Sk, que ocupó la casa Club de Sk a 72 Mt. Auburn Street. Con el tiempo, debido a las condiciones cambiantes dentro de la universidad, se convirtió en una ventaja para el Phoenix – S K para ser clasificado como un club final, por lo que el 24 de mayo de 1930, el Club se convirtió en final.
Los Multimillonarios Accidentales, una novela de 2009 de Ben Mezrich basada en la fundación de Facebook, hace referencia al proceso de punch de Phoenix – S K Club en el que Eduardo Saverin (miembro) participó y Mark Zuckerberg fue testigo en su segundo año en Harvard. La novela fue adaptada a una película importante, The Social Network, que fue lanzada el 1 de octubre de 2010.
En 2003, el Club Phoenix-S K fue investigado por crueldad animal en asociación con rituales de iniciación que involucraban criar pollos y su potencial tortura, pero nunca se llegó a una conclusión. La Red Social sugirió ficcionalmente que la crueldad implicaba canibalismo animal.
Según fuentes en línea, parece que el club ha sido un punto de acceso para celebridades y miembros de los equipos deportivos locales de Boston para participar en la vida nocturna de Harvard. En abril de 2011, el músico y DJ estadounidense Steve Aoki actuó en el club. En febrero de 2015, el club volvió a ser el centro de atención cuando aparecieron en las redes sociales imágenes de los jugadores de los New England Patriots, Julian Edelman, Danny Amendola y varios otros compañeros de equipo supuestamente de fiesta en el Club Phoenix – S K después de su victoria en el Super Bowl XLIX.