vuoden III perustuslaki, jonka Kansalliskonventti oli hyväksynyt, sijoitti toimeenpanovallan viiden jäsenen hakemistoon ja lainsäädäntövallan kahteen kamariin, muinaisten neuvostoon ja viidensadan neuvostoon (yhdessä nimeltään Corps Législatif). Tämä hallitus, porvarillinen tasavalta, olisi saattanut saavuttaa vakauden, ellei sota olisi jatkanut vallankumouksellisten ja vastavallankumouksellisten taistelua kaikkialla Euroopassa. Lisäksi sota katkeroitti olemassa olevia vastakkainasetteluja Direktorion ja lakiasäätävien neuvostojen välillä Ranskassa ja synnytti usein uusia. Nämä kiistat ratkaistiin vallankaappauksilla, pääasiassa 18 Fructidorin vuonna V (4.syyskuuta 1797), joka poisti rojalistit hakemistosta ja neuvostoista, ja 18 Brumairen vuonna VIII (9. marraskuuta 1799), jolloin Bonaparte lakkautti hakemiston ja tuli Ranskan johtajaksi sen ”ensimmäisenä konsulina”.”

Fleurusin voiton jälkeen Ranskan armeijoiden eteneminen Euroopassa oli jatkunut. Reininmaa ja Hollanti miehitettiin, ja vuonna 1795 Hollanti, Toscana, Preussi ja Espanja neuvottelivat rauhasta. Kun Bonaparten johtama Ranskan armeija saapui Italiaan (1796), Sardinia pääsi nopeasti sopuun. Itävalta taipui viimeisenä (Campo Formion rauhansopimus 1797). Useimmat ranskalaisten miehittämät maat oli organisoitu ”sisartasavalloiksi”, joiden instituutiot olivat vallankumouksellisen Ranskan mallin mukaisia.

rauha Euroopan mantereella ei kuitenkaan lopettanut vallankumouksellista laajentumista. Suurin osa johtajista oli perinyt girondistien halun levittää vallankumousta Eurooppaan ja kuunteli jakobiinien vetoomuksia ulkomailla. Niinpä ranskalaiset joukot tunkeutuivat vuosina 1798 ja 1799 Sveitsiin, Paavivaltioihin ja Napoliin ja perustivat Helvetian, Rooman ja Parthenopen tasavallat. Iso-Britannia jäi kuitenkin sotaan Ranskaa vastaan. Koska Hakemisto ei kyennyt tekemään maihinnousua Englantiin, se päätti Bonaparten pyynnöstä uhata Intiassa olevia brittejä miehittämällä Egyptin. Bonaparten johtama retkikunta valtasi helposti Maltan ja Egyptin, mutta Horatio Nelsonin laivasto tuhosi sen Niilin taistelussa 14 Thermidorissa vuonna VI (1.elokuuta 1798). Tämä katastrofi edisti vallankumouksen etenemisestä huolestuneen toisen valtaliiton muodostamista. Tämä Itävallan, Venäjän, Turkin ja Ison-Britannian muodostama Liittouma saavutti suurta menestystä kevään ja kesän 1799 aikana ja ajoi Ranskan armeijat takaisin rajoille. Bonaparte palasi tämän jälkeen Ranskaan hyödyntääkseen omaa suurta arvovaltaansa ja sitä huonoa mainetta, johon sotilaalliset vastoinkäymiset olivat johtaneet hallituksen. Hänen 18 brumairen vallankaappauksensa syrjäytti hakemiston ja korvasi konsulaatin. Vaikka Bonaparte julisti vallankumouksen päättyneeksi, hänen itsensä oli määrä levittää sitä uusissa muodoissa ympäri Eurooppaa.