hyönteisten fylogeny
tässä esitetty yksinkertaistettu sukupuu havainnollistaa siivekkäiden hyönteisten (Pterygota) oletettua evoluutiohistoriaa läpi geologisten kausien Devonikaudelta viime aikoihin. Apterygootit, joita pidetään primitiivisen hyönteiskannan eloonjääneinä, jätetään pois sukupuusta. Tummat viivat kertovat ajanjaksoista, joilta eri lahkoja on löydetty fossiileina. Jotkin linjat pysähtyvät nykyään sukupuuttoon kuolleiden ja vain fossiileina tunnettujen lahkojen nimiin. Valoviivat osoittavat eri käskyjen hypoteettisen alkuperän. Monia hyönteislajeja, joista ei ole vielä löydetty jälkiä, on täytynyt syntyä hiilikaudella ja permikaudella eläneen evoluution räjähdysmäisinä kausina.
alkeelliset siivettömät hyönteiset synnyttivät paleopteroisen kannan. Tämän kannan jälkeläisiin kuului muinaisia fossiileja, jotka kukoistivat permikaudella, kuten jättiläismäiset sudenkorennot eli Protodonata (joista joidenkin siipien väli oli yli puoli metriä) ja sudenkorennot ja neidonkorennot (Odonata) ja toukokorennot (Ephemeroptera), jotka molemmat ovat säilyneet ennallaan vähäisin muutoksin nykypäivään. Alkeellinen hyönteiskanta synnytti myös neopteroisen kannan, jonka uskottiin sisältävän jäljellä olevien hyönteislahkojen esi-isät. ”Orthoptera”) ja ”Plecoptera” (kivisirkka) on löydetty fossiileina jo myöhäishiilikaudelta. Isoptera (termiitit, joskus lahkoon blattodea), embioptera (webspinnerit) ja dermaptera (korvakuulokkeet), vaikka ne ovat epäilemättä muinaista alkuperää, niitä ei ole vielä löydetty Mesotsooista Maailmankautta (252-66 miljoonaa vuotta sitten) varhaisempina fossiileina.
evoluutiosäteilyn, jonka uskotaan synnyttäneen edellä lueteltuja luokkia keskimmäisellä hiilikaudella, arvellaan tuottaneen myös paraneopteroisen kannan, joka muodosti pohjan uudelle evoluutiosäteilylle permikaudella. Nykyiset johdannaiset tämän kannan kehittynyt Psocoptera (psocids), Mallophaga (pureskelu täitä), Anoplura tai Siphunculata (imee täitä), Thysanoptera (thrips), Heteroptera (true bugs), ja Homoptera (esim., kirvoja).
useat fylogeneettiset linjat ovat eksopterygootteja eli yksinkertaisen metamorfoosin omaavia hyönteisiä, joista osa, kuten Mallophaga ja Anoplura, ovat toissijaisesti siivettömiä. Loput lahkot ovat endopterygootteja (hyönteisiä, joilla on täydellinen metamorfoosi). Ne näkyvät sukupuussa oligoneopteroisen kannan johdannaisina, joista syntyivät Neuroptera (lacewings), Hymenoptera (muurahaiset, ampiaiset ja mehiläiset) ja Coleoptera (kovakuoriaiset) varhaisella permikaudella (298,9-272,3 miljoonaa vuotta sitten); näiden lahkojen varhainen kantamuoto on kuitenkin hämärän peitossa, ja varhaisimmat fossiilit muistuttavat läheisesti nykyisiä muotoja. Permikauden alun evolutiivisesta säteilystä yksi rivi synnytti mekopteroidikannan, ja on olemassa hyviä todisteita siitä, että näiden mekopteroidikantojen (joita joskus kutsutaan panoraamakompleksiksi) alisäteily antoi alkuperän nykyisille mekopteroille (skorpionikärpäsille), Dipteroille (oikeille kärpäsille), Siphonapteralle (kirpuille), trichopteralle (caddisflies) ja Lepidopteralle (perhosille ja yöperhosille).