lounaisosan vilkkain rajapuolustuksen keskus neljän vuosikymmenen ajan, Fort Union oli suurin Yhdysvaltain sotilasasema alueella ja tukikohta sekä sotilas-että siviilihankkeille, jotka muokkasivat sen kohtaloa. Santa Fe Trailin Vuorihaaran eteläpäässä lähellä kohtaa, jossa se yhdistyi Cimarron Cutoffin eteläiseen päätepisteeseen, se oli yksi tärkeimmistä New Mexicoon ja Etelä-Arizonaan perustetuista naruista Meksikon sodassa (1846-48) Meksikolta hankitulle alueelle.

linnoituksen tehtävä oli laaja. Se suojasi Santa Fe Trail–reittiä, jolla se oli levähdyspaikka ja kunnostuspaikka sekä pysähdyspaikka Independencelle, Missouri-Santa Fe-postivaunuille; se oli lounaisosan armeijan tärkein tarvikevarikko; toimi kuljetuskeskuksena siviilivaunujen rahtilaivoille, jotka kuljettivat sotatarvikkeita; ja tarjosi tukikohdan sotaretkille, jotka tunkeutuivat apassien, utien, Navajojen, kiowien ja comanchien kotimaahan. Myös historian vaiheessa, joka ei liity tähän määrään, linnake oli vahva rooli torjuttaessa Konfederaation hyökkäystä New Mexicoon Texasista vuonna 1862; se oli ensisijainen pysähdysalue ja logistiikkatukikohta ja tuki Coloradon vapaaehtoisten joukkoja, jotka voittivat voiton eteläisistä Glorieta Solan taistelussa New Mexicossa maaliskuussa 1862.

kolme eri Fort unionia oli olemassa vuosien varrella. Ensimmäinen, nuhjuinen hirsirakennuskokoelma pystytettiin vuonna 1851, vain viisi vuotta sen jälkeen, kun Yhdysvallat oli vallannut New Mexicon Coyote Creekin Länsirannalle. Toinen, vuonna 1861 etelävaltioiden työntöä varten aloitettu asema sijaitsi puron toisella puolella ensimmäisestä alkaen. Massiivinen, tähden muotoinen maanrakennuslinnake, jossa oli ojia, kaiteita ja pommisuojia. Työt jatkuivat katkonaisesti kesäkuuhun 1862 asti, jolloin linnoituksen tarve oli ohi. Viimeinen linnake, Suuri aluearkkitehtuurityylinen savitiilirakenteiden kompleksi, aloitettiin vuonna 1863 ja valmistui vuonna 1869. Se sijaitsi samalla alueella kuin tähtilinnake, lukuun ottamatta ensimmäisen linnoituksen paikalle rakennettua arsenaalia. Varuskunnan ehkä dramaattisin tehtävä, erityisesti intiaanien kapinoiden aikaan, oli saattueiden ja muun suojelun varustaminen Santa Fen reitille.

Rakuunat ja Ratsutetut Kiväärimiehet keskittivät voimansa cimarronin sululle, joka ulottui koilliseen Cimarronin ylityspaikalle Arkansas-joelle. Sen ylittäminen oli riskialtista, sillä se kulki kiowien ja comanchien maan läpi, mutta sen etuna oli Vuorenhaaraa lyhyempi. Sisällissodan vuodet olivat kriittisintä aikaa reitillä, koska Konfederaatio uhkasi maihinnousua ja hyökkäyksiä Trailin karavaaneihin, koska oli välttämätöntä varmistaa jatkuva muonitus unionin joukoille New Mexicossa ja kasvava Intiaaniuhka, joka johtui osittain säännöllisten joukkojen vetäytymisestä ja niiden korvaamisesta vapaaehtoisilla. Siitä huolimatta linnake, johon kuului saattajia, väliaikaisia asemia ja täysimittaisia hyökkäyskampanjoita, piti reitin auki. Jälki liittyi linnoituksen tehtävään tarvikevarikkona. Sen yli, kunnes Santa Fen rautatie saapui alueelle vuonna 1879, vyöryi pitkiä tandem-tavaravaunuja, joita vetivät 12-ikiset joukkueet ja jotka kuljettivat sotatarvikkeita linnoitukseen jaettavaksi asemiin ympäri lounaisosaa.

joukkojen raskaat keskitykset New Mexicoon ja Arizonaan hajaantuivat kaukaisille asemille. Maa ei ollut tarpeeksi rikas ruokkiakseen tämän armeijan, ja lähes kaikki muonat oli kuljetettava Santa Fen reitin yli Fort Leavenworthista Kansasista. Oli selvää, että New Mexicon itäosaan tarvittiin varikko tarvikkeiden ja taisteluvälineiden vastaanottamiseksi ja jakamiseksi.

vaunujen rahtiliikenne kasvoi niin raskaaksi, että Fort unionista tuli rahtikohde, joka kilpaili, joskaan ei ylittänyt Santa Fen merkitystä. Siviilikomppaniat suorittivat sopimuksen mukaan käytännössä kaikki sotilaalliset rahtilaivat reitillä. Rahti purettiin Fort unionissa, pakattiin uudelleen ja määrättiin tarpeen mukaan muihin tehtäviin. Kun vaunut tai kokonaiset junat sisälsivät kuljetuksia vain yhteen linnakkeeseen, ne jatkoivat usein suoraan määränpäähänsä.

Russellin, Majorsin ja Waddellin hallitsema laajamittainen sotilaallinen rahtiliikenne jatkui vuoteen 1866, jolloin rautatie siirtyi länteen Kansasiin. Jokainen rautatien pääteasema toimi sen jälkeen lyhyen aikaa tavaravaunujen noususatamana. Raiteiden saavuttua Denveriin vuonna 1870 vaunut jatkoivat tarvikkeiden siirtämistä Pueblon ja Fort unionin välisen reitin Vuorihaaran yli. Santa Fen rautatie ylitti Moran laakson vuonna 1879 ja päätti sotilaiden rahtiliikenteen aikakauden reitillä.

Santa Fen reitin suojaaminen ja alueella olevien joukkojen logistinen tuki liittyivät epäsuorasti intiaanisotiin, mutta linnake osallistui niihin myös suoraan. Kun Yhdysvallat sai Meksikon sodassa haltuunsa lounaisosan, se peri myös intiaaniongelmat, jotka olivat piinanneet sen kansaa varhaisimmista ajoista lähtien. New Mexicon paimentolaisheimot olivat taistelleet pitkään espanjalaisia ja meksikolaisia vastaan. Nyt he taistelivat amerikkalaisia vastaan, jotka valtasivat heidän maansa, tappoivat heidän riistansa tai kulkivat yli mannertenvälisten reittien matkalla Kalifornian kultakentille.

vuosina 1851-1875 Fort unionin joukot olivat yleensä kentällä kahakoimassa intiaanien kanssa. Merkittäviä sotaretkiä, joihin varuskunta osallistui ennen sisällissotaa, olivat Jicarillan apasseja vastaan vuonna 1854, Uteja vastaan vuonna 1855 Etelä-Coloradossa, joka tuolloin kuului New Mexicon territorioon, ja vuonna 1860 kiowat ja comanchet, jotka uhkasivat New Mexicon itärajoja. Intiaanit olivat erityisen hankalia sisällissodan aikana, kun vapaaehtoisten Kalifornian kolonnan päällikkö kenraali James H. Carleton johti armeijan operaatioita New Mexicossa. Heimot tarttuivat Konfederaation New Mexicoon tekemän hyökkäyksen tarjoamaan tilaisuuteen tehostaa ryöstelyään. New Mexicon ja Kalifornian vapaaehtoiset tekivät kokeneen Intiaanitaistelijan, eversti Kit Carsonin johdolla kolme suurta sotaretkeä: Mescalero-apasseja (1862-63), Navajoja (1863-64) sekä Kiowa-ja Comancheja (1864-65) vastaan.

vapaaehtoisia sisällissodan jälkeen syrjäyttäneet Fort Union Regulars osallistui muista New Mexicon asemista tulleiden joukkojen kanssa eteläisten tasankojen heimoja vastaan käytyihin viimeisiin sotiin: kenraali Sheridanin sotaretkeen 1868-69 ja Redjoen sotaan 1874-75. Nämä sotaretket lopettivat linnoituksen osallistumisen intiaanisotiin. Vuonna 1879 Santa Fe Railwayn tulo lopetti suurelta osin sen käyttökelpoisuuden tarvikevarikkona, mutta siitä luovuttiin vasta vuonna 1891.

tasangoilta jyrkästi ja räikeästi nousevat Fort unionin historian verhoamat saviset rauniot, jotka on stabiloitu pidättämään eroosiota, ovat muistutuksia kadonneesta rajasta. Rönsyilevä pohjoiseen lähes puolen kilometrin päässä vierailijakeskuksesta on muutamia savupiippuja ja ääriviivat sulanut seinät corrals, tallit, sairaala, kasarmi, upseerien neljäsosaa, ja suuria varastoja, jotka muodostivat Fort unionin vuosina 1863-91. Tämän pylvään vieressä oli massiivinen tähtilinnake (1861-62). Vuosina 1863-91 rakennetun rakennuskompleksin rauniot sijaitsevat laakson toisella puolella lännessä samalla paikalla kuin alkuperäinen hirsilinnake (1851-62), josta useimmat jäljet ovat jo kauan sitten Kadonneet. Santa Fe Trailin Poikkeukselliset reitit ovat helposti tunnistettavissa lähistöllä, ja niitä voi seurata kilometrien päähän. Museo ja vierailukeskus tulkitsevat linnoituksen historiaa, ja itseohjautuva kierros johtaa jäännösten läpi.

Fort Union sijaitsee noin 8 mailia pohjoiseen Watrousista, New Mexicosta NM Highway161: llä.