PAS staining is mainly used for staining structures containing a high proportion of carbohydrate macromolecules (glycogen, glykoproteiini, proteoglykaanit), joita esiintyy tyypillisesti esimerkiksi sidekudoksissa, Limassa, glykokalyksissa ja tyvilaminoissa.
pas-värjäystä voidaan käyttää apuna useiden sairauksien diagnosoinnissa:
- Glykogeenivarastosairaus (vs. muut varastointisairaudet).
- adenokarsinoomat, jotka erittävät usein neutraaleja muciineja.
- Pagetin rintatauti.
- alveolaarinen pehmeä osa sarkooma.
- värjää makrofageja Whipplen taudissa.
- sitä voidaan käyttää α1-antitrypsiinipuutoksen diagnosointiin, jos periportaaliset maksan maksasolut värjäytyvät positiivisiksi.
- pas-positiivisten lymfosyyttien aggregaatteja on orvaskedessä Mycosis fungoides-ja Sezary-oireyhtymissä, joita kutsutaan Pautrierin mikroabsessioiksi.
- Ewingin sarkooma
- Erytroleukemia, epäkypsien punasolujen leukemia. Nämä solut värjäävät kirkkaan fuksian.
- Keuhkoalveolaarinen proteinoosi.
- sieni-infektio, sienten soluseinät värjäävät magentan; tämä tehoaa vain eläviin sieniin. Sen sijaan Grocottin methenamine silver stain (GMS) tahraa sekä eläviä että kuolleita sienieliöitä.
- sitä käytetään glykogeenin tunnistamiseen keuhkojen biopsianäytteistä imeväisikäisiltä, joilla on keuhkojen interstitiaalinen glykogenoosi (sika).
- sitä voidaan käyttää korostamaan keroidisen lipofuskinoosin (NCL) superristikkäisiä lipidisulkeumia.
glykogeenin esiintyminen voidaan varmistaa kudososassa käyttämällä diastaasia glykogeenin sulattamiseen eräästä osiosta ja vertaamalla sitten diastaasiksi pilkottua PAS-osiota normaaliin PAS-osioon. Diastaasinegatiivisessa diassa näkyy Magenta-värjäytymä, jossa glykogeenia on kudososassa. Diastaasilla käsitellystä liukumäestä puuttuu positiivinen PAS-värjäys niissä kohdissa liukumäellä
pas-värjäystä käytetään myös selluloosan värjäykseen. Yksi esimerkki olisi etsiä implantoituja lääkinnällisiä laitteita, jotka koostuvat hapettumattomasta selluloosasta.
Jos pas-tahra tehdään kudokseen, suositeltu fiksatiivi on 10-prosenttinen neutraalipuskuroitu formaliini-tai Bouiiniliuos. Veritahroille suositeltu kiinnikeaine on metanoli. Glutaarialdehydiä ei suositella, koska vapaita aldehydiryhmiä voi olla saatavilla reagoimaan Schiff-reagenssin kanssa, mikä voi johtaa vääriin positiivisiin värjäytymisiin.