Treponema pallidum ja herpes simplex-virustyypit 1 tai 2 (HSV-1/ 2) ovat yleisimpiä sukupuoliteitse tarttuvia taudinaiheuttajia, jotka aiheuttavat sukupuolielinten, peräaukon ja nielun alueen haavaumia. Sukupuolielinten haavaumat ovat merkittävä riskitekijä ihmisen immuunikatoviruksen (HIV) tarttumisessa ja saamisessa. Mahahaavaa aiheuttavien patogeenien tunnistaminen on edellytys tehokkaalle hoidolle ja HIV-tartuntariskin vähentämiselle.
genitaaliherpeksen voi aiheuttaa kaksi hyvin samankaltaista virusta, herpes simplex-virus HSV-1 tai HSV-2, jotka ovat ensin mainitun aiheuttamia infektioita useammin. Herpes simplex-virus (HSV) -1 ja -2 ovat suuria, kaksijuosteisia DNA-viruksia, jotka aiheuttavat elinikäisiä pysyviä infektioita, joille on ominaista hiljaiset kaudet ja toistuvat sairaudet. Näitä kahta HSV-tyyppiä ei voida erottaa toisistaan kliinisesti. Itse asiassa niillä on paljon geneettistä homologiaa, mutta niillä on myös tiettyjä alueita, joilla on pieniä nukleotidivaihteluita, jotka voivat mahdollistaa syrjinnän. HSV-1-ja HSV-2-infektio
tapahtuu inokuloimalla viruspartikkeleita herkille limakalvopinnoille. Tämän jälkeen nämä neurotrooppiset virukset voivat latentua paikalliseen aistihermostoon ja aktivoitua säännöllisesti aiheuttamaan oireellisia vaurioita tai aiheuttaa oireetonta viruksen vapautumista, mikä voi johtaa taudin tarttumiseen ja infektioon. Samaa hoitoa käytetään sekä HSV-1-että HSV-2-infektioihin, leesioiden sijainti ja infektion (ensisijainen tai toistuva) kroonisuus määräävät annoksen ja esiintymistiheyden.
spirokeeta Treponema pallidum (TP), syfiliksen etiologinen aine, aiheuttaa monivaiheisen sukupuoliteitse tarttuvan infektion (STI). Patogeeniset treponeemit aiheuttavat sukupuolitautia, yaweja, endeemistä kuppaa ja pintaa—monivaiheisia infektioita, jotka, vaikka ovatkin samankaltaisia, voidaan erottaa kliinisten, epidemiologisten ja maantieteellisten kriteerien perusteella. Vain sukupuolinen kuppa tarttuu seksuaalisen aktiivisuuden välityksellä. Patogeeniset treponeemit ovat viljelemättömiä, hitaasti kasvavia mikro-organismeja, joilla on identtiset litteä-aaltomorfologiat. Ne sietävät huonosti kuivumista, kohonnutta lämpötilaa ja ympäristön happijännitystä, jotka selittävät, miksi tehokas siirto vaatii läheistä henkilökohtaista kontaktia.
Treponema pallidum-ja herpes simplex-virustyyppien 1 tai 2 diagnosointiin on käytettävissä useita laboratoriotestityyppejä. Serologia, pimeäkenttämikroskopia ja PCR ovat kultastandardeja näiden patogeenien diagnosoinnissa. Reaaliaikaisten PCR-määritysten on kuitenkin osoitettu olevan herkempi ja tarkempi diagnosointiväline niiden havaitsemiseen.