1531-ben Amerikába emigrált új földek feltárása céljából, és miután rendjét buzgón szolgálta Peruban és Guatemalában, de Nizát választották a Sonorától északra fekvő ország felfedezésére, amelynek gazdagságát a beszámolókban ábrázolták. 1537-ben megérkezett Mexikóvárosba Antonio de Mendoza alkirály kérésére. Estevanico, Cabeza de Vaca Magrebi-Berber kísérője és a Zuni hagyományok fekete Mexikója előtt 1539 márciusában elhagyta Culiac-ot, átkelt Arizona délkeleti részén a mai Lochiel közelében, behatolt Zuni vagy Cibola hét városába, és szeptemberben visszatért Culiac-Ba. Cibolát csak távolról látta, valószínűleg pontos volt a leírása, hogy Mexikóvárossal egyenlő méretű; de a Descubrimiento de las siete ciudades című jelentésében sok puszta hallomást testesített meg, amely Francisco kontra Caeclizquez de Coronado-t arra késztette, hogy jövőre híres expedícióját Zuni Pueblo-ba, a mai Új-Mexikóba vezesse, amelynek Fray Marcos volt az útmutatója; és a valóság nagy csalódásnak bizonyult.
Fray Marcost a Zuni második útja előtt a Mexikói rend tartományi felsőbbrendűjévé tették, majd 1541-ben szégyenében visszatért Mexikóvárosba, ahol egy ideig a ferencesek legmagasabb tisztségét gyakorolhatta a tartományban.