回文の構造

細菌Streptococcus agalactiaeのDNAにおける回文配列。 一方の鎖(緑色)の文字配列の部分は、逆の順序で他方の鎖(黄色)の文字配列に対応する。 しかし、回文は完璧ではありません。 また、非回文配列(白)も含まれています。 DNAは、このような壊れた回文を使用してヘアピン構造を形成することができます。

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細菌連鎖球菌agalactiaeのDNA中の回文配列。 一方の鎖(緑色)の文字配列の部分は、逆の順序で他方の鎖(黄色)の文字配列に対応する。 しかし、回文は完璧ではありません。 また、非回文配列(白)も含まれています。 DNAは、このような壊れた回文を使用してヘアピン構造を形成することができます。
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“Able was I♥I saw Elba”:このむしろ衝撃的な文は回文であり、言い換えれば、それは逆方向とまったく同じ前方を読みます。 CRISPR革命の始まりは、細菌DNAの領域に多数の繰り返し回文配列が発見されたことによって特徴づけられた。 これらの配列では、遺伝コードの文字、四つの塩基分子アデニン、シトシン、チミンおよびグアニンは、第二の相補的なDNA鎖と同じ順序を持つように順序付けられている-この場合は反対方向に読み取られる。 これは、CRISPR(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)に舌ねじれの名前を与える性質です。

意味を持つ”civic”や”tenet”のような単語回文とは異なり、遺伝学辞書の回文は意味をなさず、機能的なタンパク質に翻訳することはできません。 それにもかかわらず、彼らは完全に無意味ではありません。 DNA切断タンパク質は、しばしばDNA分子を切断する認識配列として回文配列を使用する。 いくつかの切断タンパク質は、20以上の塩基対を必要とするが、これらの配列は、四、六または八塩基対の長さであり得る。

CRISPR領域の回文配列のうち、RNA分子が転写され、非常に安定な配列(二次構造)を採用する。 それらは長さが23と47塩基対の間の範囲である。 これらの配列間に類似の長さの可変領域を見出すことができる。 それらは、細菌細胞に侵入した外来DNAのゲノムに由来し、スペーサー DNAとしても知られている。 CRISPR領域は、CRISPR領域を読み取り、CRISPR−RNA(crRNA)に翻訳することができることを確実にするプロモーターを含む。

CRISPR関連遺伝子(Cas)として知られる他の遺伝子は、それに隣接して位置する。 これらの遺伝子は、Casタンパク質、すなわちDNA鎖を切断する酵素の青写真を提供する。 CRISPRおよびスペーサー配列の後に、切断分子およびcrRNAをウイルスDNA上のそれらの標的位置に導くtracrRNAとして知られるRNA分子の領域が続く。tracrRNAは、切断分子およ

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