a área em torno do lago salgado não é habitada, mas há algum pastoreio e algum cultivo sazonal. As ameaças ao equilíbrio de salinidade decorrentes do aumento dos fluxos de siltação virão de uma exploração mais projetada em bacias hidrográficas de Natron e de uma usina hidrelétrica planejada no Ewaso Ng’iro através da fronteira no Quênia. Embora os planos de desenvolvimento incluam a construção de um dique no extremo norte do lago para conter a água doce, a ameaça de diluição para este terreno fértil pode ainda ser grave. Não há protecção formal.uma nova ameaça para o Lago Natron é o desenvolvimento proposto de uma fábrica de carbonato de sódio nas suas margens. A planta bombearia a água do lago e extraia o carbonato de sódio para converter-se ao pó de lavagem para exportação. Acompanhando a usina seria habitação para mais de 1000 trabalhadores, e uma usina a carvão para fornecer energia para o complexo da usina. Além disso, há uma possibilidade que os desenvolvedores podem introduzir um camarão salmoura híbrido para aumentar a eficiência da extração.
de Acordo com Chris Martinez, a RSPB internacional oficial para a África, “a chance de O menor flamingos continuar a raça em face de tais mayhem são próximos de zero. Este desenvolvimento deixará flamingos menores na África Oriental enfrentando a extinção”. Setenta e cinco por cento dos flamingos menores do mundo nascem no Lago Natron. Atualmente, um grupo de mais de cinquenta instituições de conservação e meio ambiente da África Oriental estão executando uma campanha mundial para parar a construção planejada da fábrica de carbonato de sódio pela Tata Chemicals Ltd de Mumbai, Índia e National Development Corporation da Tanzânia. O grupo que trabalha sob o nome de “Lake Natron Consultative Group” está a ser coordenado por Ken Mwathe, gestor do Programa de conservação no Secretariado Africano da BirdLife International.de acordo com a comunicação de junho de 2008, a Tata Chemicals não prosseguirá com o projecto Natron e a nova análise deste projecto ficará sujeita ao plano Das Zonas Húmidas de Ramsar, que está actualmente em preparação.devido à sua biodiversidade única, A Tanzânia nomeou a bacia do Lago Natron para a lista Ramsar de zonas húmidas de Importância Internacional em 4 de julho de 2001. O lago é também o Fundo Mundial da vida selvagem da ecorregião da África Oriental.