Palíndromo seqüência no DNA da bactéria Streptococcus agalactiae. As partes da sequência alfabética de uma cadeia (verde) correspondem às da outra cadeia (amarela) na ordem inversa. No entanto, o palíndromo não é perfeito. Também contém uma sequência não-palindrómica (branca). O ADN pode formar estruturas de gancho de cabelo usando um palíndromo partido como este. © MPG/Art for Science 
“foi Capaz de eu ere eu vi Elba”: este, ao invés de declaração bombástica é um palíndromo frase, em outras palavras, ele lê exatamente a mesma frente como para trás. O início da revolução CRISPR foi marcado pela descoberta de um grande número de sequências palindromáticas repetidas em uma região de DNA bacteriano. Nestas sequências, as letras do código genético, as quatro moléculas base adenina, citosina, timina e guanina, são ordenadas de tal forma que têm a mesma ordem que a segunda cadeia complementar de DNA-neste caso lida em direção oposta. Esta é a propriedade que dá a CRISPR (agrupados regularmente repetições Palíndromicas curtas Interspatadas) o seu nome de torção da língua.
Ao contrário da palavra palindromes como ‘civic’ e ‘tenet’, que têm um significado, os palindromes no dicionário de genética não fazem sentido e não podem ser traduzidos em proteínas funcionais. No entanto, não têm todo o sentido. As proteínas de corte de ADN usam frequentemente sequências palíndromo como sequências de reconhecimento, nas quais cortam a molécula de ADN. Estas sequências podem ter quatro, seis ou oito pares de base de comprimento, embora algumas proteínas de corte necessitem de 20 ou mais pares de base.
fora das sequências palindromáticas das moléculas de RNA da região CRISPR são transcritas, que adotam um arranjo muito estável (estrutura secundária). Eles variam entre 23 e 47 pares de base de comprimento. Regiões variáveis de comprimento similar podem ser encontradas entre estas sequências. Eles se originaram do genoma do DNA estranho que penetrou a célula bacteriana, e também são conhecidos como DNA spacer.
a região CRISPR inclui um promotor que garante que a região CRISPR pode ser lida e traduzida para o CRISPR-ARN (crRNA). Outros genes conhecidos como genes associados a CRISPR (Cas) estão localizados adjacentes a ele. Estes genes fornecem a planta das proteínas Cas, ou seja, as enzimas que cortam a cadeia de ADN. As sequências CRISPR e spacer são seguidas por uma região para uma molécula de RNA conhecida como tracrRNA, que guia as moléculas de corte e o crRNA para suas localizações alvo no DNA do vírus.