Treponema pallidum and herpes simplex virus types 1 ou 2 (HSV-1/ 2) são os patógenos sexualmente transmissíveis mais comuns que causam úlceras na região genital, anal e orofaríngea. As úlceras genitais são um factor de risco significativo para a transmissão e aquisição do vírus da Imunodeficiência Humana (VIH). A identificação de patógenos causadores de úlceras é um pré-requisito para uma terapêutica eficaz e para reduzir o risco de infecção pelo VIH.

Genital herpes pode ser causada por dois vírus muito semelhantes, herpes simplex vírus HSV-1 ou HSV-2, sendo as infecções causadas pelo Primeiro mais frequentemente. Vírus Herpes simplex (HSV) -1 e -2 são vírus de DNA de cadeia dupla grandes que causam infecções persistentes ao longo da vida caracterizadas por períodos de quiescência e doença recorrente. Estes dois tipos de HSV não podem ser distinguidos clinicamente. Na verdade, eles compartilham um alto grau de homologia genética, mas eles também têm regiões específicas com pequenas variações de nucleótidos que podem permitir a discriminação. A infecção HSV-1 e HSV-2 ocorre por inoculação de partículas virais em superfícies mucosas suscetíveis. Posteriormente, estes vírus neurotrópicos podem tornar-se latentes no gânglio sensorial local, reativando periodicamente para causar lesões sintomáticas, ou submeter-se a libertação assintomática viral, com potencial para transmissão da doença e infecção. O mesmo tratamento é utilizado tanto para as infecções HSV-1 como HSV-2, a localização das lesões e a cronicidade da infecção (primária ou recorrente) determinam a dosagem e frequência.a espiroqueta Treponema pallidum (Tp), o agente etiológico da sífilis, causa uma infecção sexualmente transmissível em múltiplos estágios. Treponemas patogênicos causam sífilis venérea, yaws, sífilis endêmica, e pinta—multi estágio, infecções que, embora similares, podem ser diferenciadas com base em critérios clínicos, epidemiológicos e geográficos. Só a sífilis venérea é transmitida por actividade sexual. Os treponemas patogênicos são microrganismos incultiváveis e de crescimento lento com morfologias idênticas de ondas planas. Eles mal toleram a dessecação, temperatura elevada e tensão do oxigênio ambiente, características que explicam por que a transmissão eficiente requer um contato pessoal próximo.vários tipos de testes laboratoriais estão disponíveis para diagnóstico de Treponema pallidum e herpes simplex tipo 1 ou 2. Serologia, microscopia de campo escuro e PCR são os padrões de ouro para diagnosticar esses patógenos. No entanto, os testes de PCR em tempo Real demonstraram ser uma ferramenta de diagnóstico mais sensível e específica para a sua detecção.