Las proteínas ancladas a glicosilfosfatidilinositol (GPI) son una clase de proteínas de membrana que contienen una proteína soluble unida por un anclaje de glicolípidos conservado al prospecto externo de la membrana plasmática. En las células epiteliales polarizadas, los GPI-AP se clasifican predominantemente en la superficie apical de la red trans-Golgi (TGN) agrupándose en microdominios dependientes de esfingolípidos y colesterol (o balsas), que se ha propuesto que actúen como plataformas de clasificación apical. Datos recientes indican que los mecanismos de clasificación de GPI-AP, que ocurren en el Golgi, controlan tanto el transporte de membrana de GPI-APs como su actividad específica en la superficie apical de células epiteliales completamente polarizadas. Aquí, discutimos los hallazgos más recientes y los factores que regulan la clasificación apical de GPI-APs en el Golgi en células epiteliales polarizadas. También subrayamos las diferencias en la organización de la membrana plasmática de GPI-APs entre células polarizadas y no polarizadas, lo que respalda la existencia de varios mecanismos que controlan la organización de GPI-AP en diferentes tipos de células.