den 1. November 1894 døde Aleksander III i en alder af kun 49 år i Livadia. I sin dagbog skrev Maria, ” jeg er fuldstændig sønderknust og fortvivlet, men da jeg så det salige smil og freden i hans ansigt, der kom efter, det gav mig styrke.”To dage senere ankom prinsen og prinsessen til Livadia fra London. Mens prinsen påtog sig at involvere sig i forberedelserne til begravelsen, brugte prinsessen sin tid på at trøste sørgende Maria, herunder bede med hende og sove ved hendes seng. Maria Feodorovnas fødselsdag var en uge efter begravelsen, og da det var en dag, hvor Domstolens sorg kunne være lidt afslappet, brugte Nicholas dagen til at gifte sig med Aliks af Hesse-Darmstadt, der tog navnet Aleksandra Feodorovna.som Enkekejserinde var Maria meget mere populær end enten Nicholas eller Aleksandra. Under sin søns kroning ankom hun, Nicholas og Aleksandra i separate vogne. Hun blev mødt med” næsten øredøvende ” bifald. En besøgende forfatter Kate Kool bemærkede, at hun “provokerede mere jubel fra folket end hendes søn. Folket har haft tretten år til at kende denne kvinde, og de har lært at elske hende meget.”Richard Harding Davis, en amerikansk journalist, var overrasket over, at hun “blev mere højlydt mødt end enten kejseren eller Tsarina.”Da Aleksandr III’ s død var aftaget, tog Maria igen et lysere syn på fremtiden. “Alt vil være okay”, som hun sagde. Maria fortsatte med at bo i Anichkov-paladset i Skt. I Maj 1896 rejste hun til Moskva for kroningen af Nicholas og Aleksandra.da et nyt Kejserligt tog blev bygget til Nicholas II i tide til hans kroning, blev Aleksander IIIs “midlertidige kejserlige tog” (sammensat af de biler, der havde overlevet Borki-katastrofen og et par konverterede standard personbiler) overført til kejserindeens personlige brug.
i de første år af sin søns regeringstid fungerede Maria ofte som den politiske rådgiver for tsaren. Usikker på sin egen evne og opmærksom på hendes forbindelser og viden fortalte Tsar Nicholas II ofte ministrene, at han ville bede hende om råd, før han tog beslutninger, og ministrene foreslog undertiden dette selv. Det var efter sigende på hendes råd, at Nicholas oprindeligt holdt sin fars ministre. Maria vurderede selv, at hendes søn var af svag karakter, og at det var bedre, at han blev påvirket af hende end nogen værre. Hendes datter Olga bemærkede sin indflydelse: “hun havde aldrig før taget den mindste interesse … nu følte hun, at det var hendes pligt. Hendes personlighed var magnetisk,og hendes aktivitet var utrolig. Hun havde fingeren på hver uddannelsespuls i imperiet. Hun ville arbejde sine sekretærer til strimler, men hun sparer ikke sig selv. Selv når hun keder sig i udvalget, så hun aldrig keder sig. Hendes måde og frem for alt hendes takt erobrede alle”. Efter sin ægtefælles død blev Maria overbevist om, at Rusland havde brug for reformer for at undgå en revolution. Ifølge Hofmanden Paul Benckendorff var der en scene, da Maria bad sin søn om ikke at udnævne den konservative Vehl til indenrigsminister: “hvor man næsten kastede sig på knæ og bad ham om ikke at foretage denne udnævnelse og vælge nogen, der kunne give indrømmelser. Hun sagde, at hvis Nicholas ikke var enig, ville hun’rejse til Danmark, og så uden mig her lade dem vride dit hoved rundt'”. Nicholas udnævnte sin foretrukne kandidat, og hun fortalte angiveligt sin foretrukne kandidat den liberale reformist Peter Sviatopolk-Mirsky at acceptere ved at sige: “Du skal opfylde min søns ønske; hvis du gør det, vil jeg give dig et kys”. Efter fødslen af en søn til tsaren samme år erstattede Nicholas II imidlertid sin mor som sin politiske fortrolige og rådgiver med sin kone, kejserinde Aleksandra.Maria Feodorovnas svigersøn, Prins Feliks Yusupov, bemærkede, at hun havde stor indflydelse i Romanov-familien. Sergei Vitte roste hendes takt og diplomatiske dygtighed. På trods af sin sociale takt kom hun ikke godt overens med sin svigerdatter, Tsarina Aleksandra, og holdt hende ansvarlig for mange af de problemer, der ramte hendes søn Nicholas og det russiske imperium generelt. Hun var forfærdet over Aleksandras manglende evne til at vinde gunst hos offentligheden, og også at hun ikke fødte en arving før næsten ti år efter sit ægteskab, efter at have båret fire døtre. Det faktum, at den russiske domstol skik dikterede, at en Enkekejserinde havde forrang over en kejserinde gemalinde, kombineret med besiddertrang, at Maria havde af sine sønner, og hendes jalousi kejserinde Aleksandra kun tjente til at forværre spændingerne mellem svigermor og svigerdatter. Sophie bemærkede om denne konflikt:” uden egentlig sammenstød syntes de grundlæggende ude af stand til … at forstå hinanden”, og hendes datter Olga kommenterede: “de havde forsøgt at forstå hinanden og mislykkedes. De var helt forskellige i karakter, vaner og udsigter”. Maria var omgængelig og en god danser med en evne til at glæde sig over mennesker, mens Aleksandra, selvom den var intelligent og smuk, var meget genert og lukkede sig for det russiske folk.
Ved begyndelsen af det tyvende århundrede brugte Maria stigende tid i udlandet. I 1906, efter deres fars død, købte hun og hendes søster, Aleksandra, der i 1901 var blevet dronning af Storbritannien, villaen til hvid Laurre. Det følgende år gjorde en ændring i de politiske omstændigheder det muligt for Maria Feodorovna at blive budt velkommen til England af kong Edvard VII og Dronning Aleksandra, Marias første besøg i England siden 1873. Efter et besøg i begyndelsen af 1908 var Maria Feodorovna til stede ved sin svoger og søsters besøg i Rusland den sommer. Lidt under to år senere rejste Maria Feodorovna endnu en gang til England, denne gang til begravelsen af sin svoger, kong Edvard VII, i maj 1910. Under sit næsten tre måneders besøg i England i 1910 forsøgte Maria Feodorovna uden held at få sin søster, nu enkedronning Aleksandra, til at gøre krav på en forrang over sin svigerdatter, Dronning Mary.
kejserinde Maria Feodorovna, elskerinde Langinkoski tilbagetog, var også ellers en kendt ven af Finland. I løbet af den første russificeringsperiode forsøgte hun at få sin søn til at standse begrænsningen af det store Fyrstedømmes autonomi og at huske den upopulære Guvernør-General Bobrikov fra Finland til en anden position i Rusland selv. I løbet af den anden russificeringsperiode, i starten af Første Verdenskrig, kejserinde enkemand, der rejste med sit specielle tog gennem Finland til Sankt Petersborg, udtrykte sin fortsatte afvisning for russificering af Finland ved at lade et orkester fra et indbydende udvalg spille Pori Regimentets March og den finske nationalsang “Maamme”, som på det tidspunkt var under det eksplicitte forbud fra Frans Albert seyn, Finlands generalguvernør.
i 1899 døde Marias anden søn, George, af tuberkulose i Kaukasus. Under begravelsen, hun holdt sin ro, men i slutningen af gudstjenesten, hun løb fra kirken og greb sin søns top hat, der var oven på kisten og kollapsede i sin vogn hulkende.i 1892 arrangerede Maria Olgas katastrofale ægteskab med Peter, hertug af Oldenburg. I årevis nægtede Nicholas at give sin ulykkelige søster en skilsmisse, først relenting i 1916 midt i krigen. Da Olga forsøgte at indgå et morganatisk ægteskab med Nikolai Kulikovsky, forsøgte Maria Feodorovna og tsaren at afskrække hende, men de protesterede ikke for voldsomt. Faktisk var Maria Feodorovna en af de få mennesker, der deltog i brylluppet i November 1916.
i 1912 stod Maria over for problemer med sin yngste søn, da han i hemmelighed giftede sig med sin elskerinde, meget til forargelse og skandale for både Maria Feodorovna og Nicholas.Maria Feodorovna kunne ikke lide Rasputin og forsøgte uden held at overbevise Nicholas og Aleksandra om at sende ham væk. Hun betragtede Rasputin som en farlig charlatan og fortvivlede over Aleksandras besættelse af “skøre, beskidte, religiøse fanatikere. Hun var bekymret for, at Rasputins aktiviteter beskadigede den kejserlige families prestige og bad Nicholas og Aleksandra om at sende ham væk. Nicholas forblev tavs, og Aleksandra nægtede. Maria erkendte, at kejserinden var den sande regent, og at hun også manglede evnen til en sådan stilling: “min stakkels svigerdatter opfatter ikke, at hun ødelægger dynastiet og sig selv. Hun tror oprigtigt på en eventyrers hellighed, og vi er magtesløse til at afværge ulykken, som helt sikkert kommer.”Da tsaren afskedigede minister Vladimir Kokovtsov i februar 1914 efter råd fra Aleksandra, bebrejdede Maria igen sin søn, der svarede på en sådan måde, at hun blev endnu mere overbevist om, at Aleksandra var den virkelige hersker over Rusland, og hun opfordrede Kokovtsov og sagde til ham: “Min svigerdatter kan ikke lide mig; hun mener, at jeg er misundelig på hendes magt. Hun opfatter ikke, at min eneste ambition er at se min søn glad. Alligevel ser jeg, at vi nærmer os en slags katastrofe, og tsaren lytter til ingen andre end smigrere… Hvorfor fortæller du ikke tsaren alt, hvad du tænker og ved… hvis det ikke allerede er for sent”.
første verdenskrigRediger
I maj 1914 rejste Maria Feodorovna til England for at besøge sin søster. Mens hun var i London, Første Verdenskrig brød ud (juli 1914) og tvang hende til at skynde sig hjem til Rusland. I Berlin forhindrede de tyske myndigheder hendes tog i at fortsætte mod den russiske grænse. I stedet måtte hun vende tilbage til Rusland gennem (neutralt) Danmark og Finland. Da hun vendte tilbage i August, tog hun ophold på Yelagin Palace, som var tættere på St. Petersborg (omdøbt til Petrograd i August 1914) end Gatchina. Under krigen tjente hun som præsident for Ruslands Røde Kors. Som hun havde gjort et årti tidligere i den russisk-japanske krig 1904-1905, finansierede hun også et sanitært tog.under krigen var der stor bekymring i det kejserlige hus over den indflydelse, kejserinde Aleksandra havde på statsanliggender gennem tsaren, og den indflydelse, Grigori Rasputin blev antaget at have på hende, da det blev anset for at provokere offentligheden og bringe den kejserlige TRONs sikkerhed og monarkiets overlevelse i fare. På vegne af tsarens kejserlige slægtninge var både kejserindeens søster storhertuginde Elisabeth Feodorovna og hendes fætter storhertuginde Victoria Feodorovna blevet udvalgt til at mægle og bede kejserinde Aleksandra om at forvise Rasputin fra retten for at beskytte hende og tronens omdømme, men uden succes. Parallelt havde flere af storhertugerne forsøgt at gribe ind med tsaren, men uden mere succes.under denne konflikt fra 1916-1917 planlagde Storhertuginden Maria Pavlovna angiveligt et statskup for at afsætte tsaren ved hjælp af fire regimenter fra den kejserlige garde, der skulle invadere Aleksandr-paladset, tvinge tsaren til at abdicere og erstatte ham med sin mindreårige søn under regency af hendes søn Storhertug Kirill.
der er dokumenter, der understøtter det faktum, at Maria Feodorovna i denne kritiske situation var involveret i et planlagt statskup for at afsætte sin søn fra tronen for at redde monarkiet. Planen var angiveligt, at Maria skulle stille et sidste ultimatum til tsaren for at forvise Rasputin, medmindre han ønskede, at hun skulle forlade hovedstaden, hvilket ville være signalet om at frigøre kuppet. Præcis hvordan hun planlagde at erstatte sin søn er ubekræftet, men to versioner er tilgængelige: for det første, at Storhertug Paul Aleksandrovich fra Rusland ville tage magten i hendes navn, og at hun selv derefter ville blive herskende kejserinde; den anden version hævder endvidere, at Storhertug Paul Aleksandrovich af Rusland ville erstatte tsaren med sin søn, tronarving, Marias barnebarn Aleksey, hvorpå Maria og Paul Aleksandrovich ville dele magten som regenter under hans mindretal. Maria blev bedt om at appellere til tsaren, efter at kejserinde Aleksandra havde bedt tsaren om at afskedige minister Polianov. Oprindeligt nægtede hun at appellere, og hendes svigerinde storhertuginde Maria Pavlovna sagde til den franske ambassadør: “det er ikke mangel på mod eller tilbøjelighed, der holder hende tilbage. Det er bedre, at hun ikke gør det. Hun er for åbenhjertig og imperious. I det øjeblik hun begynder at belære sin søn, løber hendes følelser væk med hende; hun siger undertiden det nøjagtige modsatte af, hvad hun skal; hun irriterer og ydmyger ham. Så står han på sin værdighed og minder sin mor om, at han er kejseren. De forlader hinanden i et raseri.”Til sidst var hun dog overbevist om at gøre appellen. Efter sigende blev kejserinde Aleksandra informeret om det planlagte kup, og Da Maria Feodorovna stillede ultimatumet til tsaren, overbeviste kejserinden ham om at beordre sin mor til at forlade hovedstaden. Derfor forlod kejserinde Enken Petrograd for at bo i Mariyinsky-paladset i Kiev samme år. Hun vendte aldrig tilbage til Ruslands hovedstad. Kejserinde Aleksandra kommenterede sin afgang:”det er meget bedre Motherdear bliver … i Kiev, hvor klimaet er bedre, og hun kan leve som hun ønsker og hører mindre sladder”.
i Kiev deltog Maria i Røde Kors og hospitalsarbejde, og i September blev 50-årsdagen for hendes ankomst til Rusland fejret med store festligheder, hvor hun blev besøgt af sin søn, Nicholas II, der kom uden sin kone. Kejserinde Aleksandra skrev til tsaren:” når du ser Morkære, skal du temmelig skarpt fortælle hende, hvor smertefuldt du er, at hun lytter til bagvaskelse og ikke stopper det, da det gør ondt, og andre ville være glade, jeg er sikker på, at sætte hende imod mig… ” Maria bad Nicholas II om at fjerne både Rasputin og Aleksandra fra al politisk indflydelse, men kort efter Brød Nicholas og Aleksandra al kontakt med tsarens familie.da Rasputin blev myrdet, bad en del af de kejserlige slægtninge Maria om at vende tilbage til hovedstaden og bruge øjeblikket til at erstatte Aleksandra som tsarens politiske rådgiver. Maria nægtede, men hun indrømmede, at Aleksandra skulle fjernes fra indflydelse på statslige anliggender: “Aleksandra Feodorovna skal forvises. Ved ikke hvordan, men det skal gøres. Ellers kan hun blive helt sur. Lad hende komme ind i et kloster eller bare forsvinde.”