Dal settembre 1960 all’ottobre 1962, Rogozov ha lavorato in Antartide, nel suo ruolo di unico medico per un team di tredici ricercatori presso la stazione di Novolazarevskaya, fondata nel gennaio 1961.
La mattina del 29 aprile 1961, Rogozov avvertì debolezza generale, nausea e febbre moderata, e successivamente dolore nella parte inferiore destra dell’addome. Nessuno dei possibili trattamenti conservativi ha aiutato. Entro il 30 aprile i segni di peritonite localizzata divennero evidenti, e le sue condizioni peggiorarono notevolmente entro la sera. Mirny, la stazione di ricerca sovietica più vicina, era più di 1.000 miglia da Novolazarevskaya. Le stazioni di ricerca antartiche di altri paesi non avevano un aereo disponibile. Gravi condizioni di bufera di neve hanno impedito l’atterraggio degli aerei in ogni caso. Rogozov non aveva altra scelta che eseguire un’operazione su se stesso.
L’operazione è iniziata alle 02:00 ora locale del 1 ° maggio con l’aiuto di un autista e di un meteorologo, che ha fornito strumenti e tenuto uno specchio in modo che Rogozov potesse osservare aree non direttamente visibili. Rogozov giaceva in una posizione semi-reclinata, semi-girata verso il suo lato sinistro. Una soluzione di 0.il 5% di novocaina è stato utilizzato per l’anestesia locale della parete addominale. Rogozov fece un’incisione di 10-12 cm della parete addominale, ma mentre apriva il peritoneo tagliò accidentalmente il cieco e dovette suturarlo. Poi ha esposto l’appendice. Secondo il suo rapporto, l’appendice è stata trovata per avere una macchia scura alla sua base, e Rogozov ha stimato che sarebbe scoppiata in un giorno. L’appendice è stata resecata e gli antibiotici sono stati applicati direttamente nella cavità peritoneale. La debolezza generale e la nausea si sono sviluppate circa 30-40 minuti dopo l’inizio dell’operazione in modo che siano state ripetutamente necessarie brevi pause per il riposo. Verso le 04: 00 l’operazione era completa.
Dopo l’operazione si è verificato un graduale miglioramento nei segni di peritonite e nelle condizioni generali di Rogozov. La temperatura corporea è tornata alla normalità dopo cinque giorni e i punti sono stati rimossi sette giorni dopo l’operazione. Ha ripreso le sue funzioni regolari in circa due settimane. L’auto-chirurgia catturò l’immaginazione del pubblico sovietico all’epoca. Nel 1961 è stato insignito dell’Ordine della Bandiera Rossa del Lavoro. L’incidente ha provocato un cambiamento di politica, e da allora in poi, ampi controlli sanitari sono stati obbligatori per il personale da schierare su tali spedizioni.